RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000154294.7

Ccdc42-203, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Ccdc42, Length 1,384 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Lrrc47Q505F5 581 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Zfp658Q5PPQ4 887 aa15.96■□□□□ 0.15
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 PkdccQ5RJI4 492 aa15.96■□□□□ 0.15
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Bdkrb1Q61125 334 aa15.96■□□□□ 0.15
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Slc20a1Q61609 681 aa15.96■□□□□ 0.15
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Adamtsl4Q80T21 1036 aa15.96■□□□□ 0.15
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Wdr35Q8BND3 1181 aa15.96■□□□□ 0.15
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Leg1Q8C6C9 337 aa15.96■□□□□ 0.15
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Ccdc73Q8CDM4 1066 aa15.96■□□□□ 0.15
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Ccdc17Q8CE13 565 aa15.96■□□□□ 0.15
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Rell1Q8K2J7 272 aa15.96■□□□□ 0.15
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 D8Ertd738eQ8R1F0 94 aa15.96■□□□□ 0.15
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Olfr1353Q8VGU8 309 aa15.96■□□□□ 0.15
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Cst12Q9DAN8 128 aa15.96■□□□□ 0.15
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Tex21Q9R0U9 575 aa15.96■□□□□ 0.15
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Atg2aQ6P4T0 1914 aa15.96■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Arid2E9Q7E2 1828 aa15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Ighv11-2A0A075B5R8 117 aa15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Atp8b5A3FIN4 1183 aa15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Gm10718D3Z1I7 227 aa15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Nolc1E9Q5C9 702 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Ly6aP05533 134 aa15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Zhx1P70121 873 aa15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Ntsr2P70310 416 aa15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Serac1Q3U213 654 aa15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Foxn3Q499D0 457 aa15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Spire1Q52KF3 598 aa15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Q6GQV0 436 aa15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Znf598Q80YR4 908 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Rhpn2Q8BWR8 686 aa15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Slfn5Q8CBA2 884 aa15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Cog3Q8CI04 820 aa15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Zfp566Q8VCI1 386 aa15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Afg3l1Q920A7 789 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Ophn1Q99J31 802 aa15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Gdap2Q9DBL2 498 aa15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Dpysl5Q9EQF6 564 aa15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Gtf2ird1Q9JI57 1104 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Noc2lQ9WV70 747 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Pld1Q9Z280 1074 aa15.95■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Dock1Q8BUR4 1865 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 9330159F19RikD3Z623 648 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 4933406M09RikG3XA12 479 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 TyrP11344 533 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Gas2l3Q3UWW6 683 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Cep135Q6P5D4 1140 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Ttyh3Q6P5F7 524 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Tcp10aQ80W76 438 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Atat1Q8K341 421 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 MrgpreQ91ZB7 310 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Mrpl9Q99N94 265 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Tlr2Q9QUN7 784 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Pdzd4Q9QY39 772 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Smarcb1Q9Z0H3 385 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Col27a1Q5QNQ9 1845 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Cdc27A2A6Q5 825 aa15.93■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Spryd3E9Q9B3 442 aa15.93■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Tnfrsf11aO35305 625 aa15.93■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Wisp1O54775 367 aa15.93■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Cct6aP80317 531 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Krt80Q0VBK2 452 aa15.93■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Olfr1105Q7TR58 312 aa15.93■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Spata20Q80YT5 790 aa15.93■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Lancl3Q8CD19 420 aa15.93■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Psmd2Q8VDM4 908 aa15.93■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Olfr385Q8VGT1 312 aa15.93■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 BccipQ9CWI3 316 aa15.93■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Kbtbd12Q9D618 625 aa15.93■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 PirQ9D711 290 aa15.93■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Prmt2Q9R144 448 aa15.93■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Ptpn3A2ALK8 913 aa15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Bpifb4A2BGH0 617 aa15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Gm1661E9Q963 441 aa15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Phox2bO35690 314 aa15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Gnl1P36916 607 aa15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Wbp1P97764 304 aa15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Srbd1Q497V5 1015 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Rnf43Q5NCP0 784 aa15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Fkbp3Q62446 224 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 RetsatQ64FW2 609 aa15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Jade2Q6ZQF7 829 aa15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Bank1Q80VH0 783 aa15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Lrfn3Q8BLY3 626 aa15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 B130006D01RikQ8BRH6 153 aa15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 AgmoQ8BS35 447 aa15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Timd2Q8R183 305 aa15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Pde6cQ91ZQ1 861 aa15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Psmd6Q99JI4 389 aa15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Smarcd2Q99JR8 531 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Mrpl14Q9D1I6 145 aa15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Sdr42e1Q9D665 394 aa15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Trpv2Q9WTR1 756 aa15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Stk25Q9Z2W1 426 aa15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 CitP49025 2055 aa15.91■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Zfp40B1B1D3 796 aa15.91■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Wdr72D3YYM4 1114 aa15.91■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Fam129cD3YZB0 591 aa15.91■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Ugt1a8D3Z748 530 aa15.91■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Fam167bP17257 162 aa15.91■□□□□ 0.14
Ccdc42-203ENSMUST00000154294 Tnnc2P20801 160 aa15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 109.6 ms