RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000084589.10

Cln3-202, Transcript of Battenin, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cln3, Length 3,203 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3-202ENSMUST00000084589 Fndc3c1Q6DFV6 1356 aa9.96□□□□□ -0.81
Cln3-202ENSMUST00000084589 Zscan4-ps1A0A1C7CYV3 506 aa9.96□□□□□ -0.81
Cln3-202ENSMUST00000084589 Zscan4dA7KBS4 506 aa9.96□□□□□ -0.81
Cln3-202ENSMUST00000084589 Gm5926E9PWJ8 236 aa9.96□□□□□ -0.81
Cln3-202ENSMUST00000084589 Kif2aP28740 705 aa9.96□□□□□ -0.81
Cln3-202ENSMUST00000084589 Cetn1P41209 172 aa9.96□□□□□ -0.81
Cln3-202ENSMUST00000084589 DmpkP54265 631 aa9.96□□□□□ -0.81
Cln3-202ENSMUST00000084589 SnrpfP62307 86 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
Cln3-202ENSMUST00000084589 Irf3P70671 419 aa9.96□□□□□ -0.81
Cln3-202ENSMUST00000084589 9130409I23RikQ3TS87 320 aa9.96□□□□□ -0.81
Cln3-202ENSMUST00000084589 Mrgprb1Q3UG61 350 aa9.96□□□□□ -0.81
Cln3-202ENSMUST00000084589 Ppp1r12cQ3UMT1 782 aa9.96□□□□□ -0.81
Cln3-202ENSMUST00000084589 Tars2Q3UQ84 723 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
Cln3-202ENSMUST00000084589 Zscan4fQ3URS2 506 aa9.96□□□□□ -0.81
Cln3-202ENSMUST00000084589 Sh2d1b2Q45HK4 132 aa9.96□□□□□ -0.81
Cln3-202ENSMUST00000084589 Abi3bpQ59IW6 1179 aa9.96□□□□□ -0.81
Cln3-202ENSMUST00000084589 Git1Q68FF6 770 aa9.96□□□□□ -0.81
Cln3-202ENSMUST00000084589 PrcpQ7TMR0 491 aa9.96□□□□□ -0.81
Cln3-202ENSMUST00000084589 Zscan4cQ80VJ6 506 aa9.96□□□□□ -0.81
Cln3-202ENSMUST00000084589 Ttc22Q8C159 568 aa9.96□□□□□ -0.81
Cln3-202ENSMUST00000084589 Wdr27Q8C5V5 780 aa9.96□□□□□ -0.81
Cln3-202ENSMUST00000084589 Fam133bQ9CVI2 245 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
Cln3-202ENSMUST00000084589 Tdrd12Q9CWU0 1215 aa9.96□□□□□ -0.81
Cln3-202ENSMUST00000084589 Tekt1Q9DAJ2 418 aa9.96□□□□□ -0.81
Cln3-202ENSMUST00000084589 Igdcc4Q9EQS9 1252 aa9.96□□□□□ -0.81
Cln3-202ENSMUST00000084589 Cyp39a1Q9JKJ9 470 aa9.96□□□□□ -0.81
Cln3-202ENSMUST00000084589 Piwil1Q9JMB7 862 aa9.96□□□□□ -0.81
Cln3-202ENSMUST00000084589 Gm13084A2A8N0 494 aa9.96□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 BhmtO35490 407 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Rasgrf1P27671 1262 aa9.96□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Oca2Q62052 833 aa9.96□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Lilrb4Q64281 335 aa9.96□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Jade1Q6ZPI0 834 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Fam102aQ78T81 392 aa9.96□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Nacc1Q7TSZ8 514 aa9.96□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Wscd1Q80XH4 572 aa9.96□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Pqbp1Q91VJ5 263 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Zmat2Q9CPW7 199 aa9.96□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Spc24Q9D083 201 aa9.96□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Nxnl2Q9D531 156 aa9.96□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Rilpl1Q9JJC6 406 aa9.96□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Speer2E9Q9U2 264 aa9.95□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Gm17535J3KMR8 224 aa9.95□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Fgf15O35622 218 aa9.95□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Tap2P36371 702 aa9.95□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Adcy8P97490 1249 aa9.95□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Nfe2Q07279 373 aa9.95□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Gpr151Q7TSN6 422 aa9.95□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Eif4bQ8BGD9 611 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 SowahaQ8BLS7 548 aa9.95□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Kctd15Q8K0E1 283 aa9.95□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Hdhd5Q91WM2 419 aa9.95□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Trim66Q924W6 1242 aa9.95□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Lrrc71Q9D3W5 558 aa9.95□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Nr1h3Q9Z0Y9 445 aa9.95□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Dnah12Q3V0Q1 3086 aa9.95□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Cyp2b13A6H6J2 491 aa9.95□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Aoc3O70423 765 aa9.95□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 SftpdP50404 374 aa9.95□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Pid1Q3UBG2 217 aa9.95□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Vav2Q60992 868 aa9.95□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Txndc8Q69AB2 127 aa9.95□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Sh2b2Q9JID9 621 aa9.95□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Gabbr1Q9WV18 960 aa9.95□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Vmn2r121A2BE32 847 aa9.95□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Ccdc152E9PX14 254 aa9.95□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 R3hdm1E9Q9Q2 1135 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Kng1O08677 661 aa9.95□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Ess2O70279 479 aa9.95□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Oas1fQ14AZ4 364 aa9.95□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Emc10Q3TAS6 258 aa9.95□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Ppp4r3cQ3V0Y1 813 aa9.95□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Clul1Q3ZRW6 464 aa9.95□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Mtus1Q5HZI1 1210 aa9.95□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Fmnl3Q6ZPF4 1028 aa9.95□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Zbtb5Q7TQG0 670 aa9.95□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Q8BGD0 127 aa9.95□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Creb3l2Q8BH52 521 aa9.95□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Qsox1Q8BND5 748 aa9.95□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Phka2Q8BWJ3 1235 aa9.95□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Adgrg2Q8CJ12 1009 aa9.95□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Tti1Q91V83 1085 aa9.95□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Rxfp2Q91ZZ5 737 aa9.95□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 GzmnQ920S1 248 aa9.95□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Bbs5Q9CZQ9 341 aa9.95□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Gm10801F7C7Q0 168 aa9.94□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Pitpnm1O35954 1243 aa9.94□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Uhmk1P97343 419 aa9.94□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Ppm1jQ149T7 507 aa9.94□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 HrQ61645 1182 aa9.94□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Stk40Q7TNL3 435 aa9.94□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Camta2Q80Y50 1208 aa9.94□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Serpina3bQ8BYY9 420 aa9.94□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Pcdha9Q91Y11 979 aa9.94□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Prmt7Q922X9 692 aa9.94□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Trim54Q9ERP3 366 aa9.94□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Tspan3Q9QY33 253 aa9.94□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Dnajb7Q9QYI8 312 aa9.94□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Krt71Q9R0H5 524 aa9.94□□□□□ -0.82
Cln3-202ENSMUST00000084589 Gys1Q9Z1E4 738 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.2 ms