RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639895.1

SPIN3-231, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 4,234 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-231	ENST00000639895	AADACL2	Q6P093	401 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	PHC3	Q8NDX5	983 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	AGR3	Q8TD06	166 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	CFAP36	Q96G28	342 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	THAP2	Q9H0W7	228 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	BTG4	Q9NY30	223 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	NMT2	O60551	498 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	OR6B1	O95007	311 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	FUT4	P22083	530 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	PARP10	Q53GL7	1025 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	DUPD1	Q68J44	220 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	MTA3	Q9BTC8	594 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	SNX25	Q9H3E2	840 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	CPVL	Q9H3G5	476 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	EBF3	Q9H4W6	596 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	CES2	O00748	559 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	VCL	P18206	1134 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	SOX5	P35711	763 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	BCAM	P50895	628 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	COPA	P53621	1224 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	ARL4C	P56559	192 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	PICALM	Q13492	652 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	ANO4	Q32M45	955 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	CCDC153	Q494R4	210 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895		H0YGN5	161 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	ADRA1D	P25100	572 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	EMC10	Q5UCC4	262 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	WDR78	Q5VTH9	848 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	NFS1	Q9Y697	457 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	PEAK1	Q9H792	1746 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	TMEM253	P0C7T8	217 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	UQCRB	P14927	111 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	ARSE	P51690	589 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	HSPA2	P54652	639 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	MIIP	Q5JXC2	388 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	CENPP	Q6IPU0	288 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	ACAD11	Q709F0	780 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	VPS50	Q96JG6	964 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	ING2	Q9H160	280 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895		E9PMD0	336 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	TAF4	O00268	1085 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	FOLH1	Q04609	750 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	LSAMP	Q13449	338 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	FLOT2	Q14254	428 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF24	P17028	368 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	CDC16	Q13042	620 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	MYBPC2	Q14324	1141 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	FSCB	Q5H9T9	825 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	DMTF1	Q9Y222	760 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	AP3B1	O00203	1094 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	GNPAT	O15228	680 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	ALAD	P13716	330 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	BGN	P21810	368 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	NR1H2	P55055	460 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	AQP5	P55064	265 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	GEN1	Q17RS7	908 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	RGS21	Q2M5E4	152 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-231	ENST00000639895	RAD54L	Q92698	747 aa		11.91	□□□□□ -0.5

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