RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636426.1

ARID1B-216, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, humanhuman

TSL 5

Gene ARID1B, Length 1,489 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID1B-216ENST00000636426 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 PNPLA4P41247 253 aa11.64□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 GCLMP48507 274 aa11.64□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 MRE11P49959 708 aa11.64□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 TYRO3Q06418 890 aa11.64□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 PTPN14Q15678 1187 aa11.64□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 RTP2Q5QGT7 225 aa11.64□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 KIAA0319Q5VV43 1072 aa11.64□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 APPL2Q8NEU8 664 aa11.64□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 HPDLQ96IR7 371 aa11.64□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 SIX4Q9UIU6 781 aa11.64□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 PCDHB8Q9UN66 801 aa11.64□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 ARHGEF37A1IGU5 675 aa11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 SYN3O14994 580 aa11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 STX10O60499 249 aa11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 EFEMP2O95967 443 aa11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 CNPP09543 421 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 CCDC192P0DO97 292 aa11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 ODC1P11926 461 aa11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 RPL17P18621 184 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 FGFR3P22607 806 aa11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 ARPP19P56211 112 aa11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 CLDN10P78369 228 aa11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 HYAL1Q12794 435 aa11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 PSMD5Q16401 504 aa11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 LLGL2Q6P1M3 1020 aa11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 PDXDC1Q6P996 788 aa11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 FOXR2Q6PJQ5 311 aa11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 ANKS3Q6ZW76 656 aa11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 SV2AQ7L0J3 742 aa11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 FRMD5Q7Z6J6 570 aa11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 METTL23Q86XA0 190 aa11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 LRRC52Q8N7C0 313 aa11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 BORCS6Q96GS4 357 aa11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 KLHL5Q96PQ7 755 aa11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 MMS19Q96T76 1030 aa11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 DNAJC25Q9H1X3 360 aa11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 SNX9Q9Y5X1 595 aa11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 LAMA3Q16787 3333 aa11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 NLRC5Q86WI3 1866 aa11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 CITO14578 2027 aa11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 SYCE3A1L190 88 aa11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 SPDYE4A6NLX3 237 aa11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 H7C4K7 107 aa11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 HUS1O60921 280 aa11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 PIK3CAP42336 1068 aa11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 MYL6P60660 151 aa11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 PPP3CAQ08209 521 aa11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 NCOA4Q13772 614 aa11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 DUSP6Q16828 381 aa11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 CTXN3Q4LDR2 81 aa11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 C1orf220Q5T0J3 134 aa11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 PALB2Q86YC2 1186 aa11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 PIK3R5Q8WYR1 880 aa11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 MED15Q96RN5 788 aa11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 TMEM8AQ9HCN3 771 aa11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.558e-7■■■■■ 91.3
ARID1B-216ENST00000636426 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 CLDND1Q9NY35 253 aa11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 IRAK3Q9Y616 596 aa11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 KIAA1671Q9BY89 1806 aa11.63□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 M0QZQ0 153 aa11.62□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 TEX28O15482 410 aa11.62□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 NCK2O43639 380 aa11.62□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 LILRB3O75022 631 aa11.62□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 HLA-DRAP01903 254 aa11.62□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 ADH1AP07327 375 aa11.62□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 ATICP31939 592 aa11.62□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 GTF2H1P32780 548 aa11.62□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 OR1D2P34982 312 aa11.62□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP11.62□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 MXI1P50539 228 aa11.62□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 TNNC1P63316 161 aa11.62□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 CREMQ03060 361 aa11.62□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 ENPEPQ07075 957 aa11.62□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa11.62□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 ZNF699Q32M78 642 aa11.62□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 WDR72Q3MJ13 1102 aa11.62□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 ZACNQ401N2 412 aa11.62□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 ANO6Q4KMQ2 910 aa11.62□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 WSCD1Q658N2 575 aa11.62□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 KRT39Q6A163 491 aa11.62□□□□□ -0.55
ARID1B-216ENST00000636426 OVOS1Q6IE37 1185 aa11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.4 ms