RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635861.1

CLN3-241, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5

Gene CLN3, Length 1,404 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-241ENST00000635861 FOXK2Q01167 660 aa20.03■□□□□ 0.8
CLN3-241ENST00000635861 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
CLN3-241ENST00000635861 ADCY1Q08828 1119 aa20.03■□□□□ 0.8
CLN3-241ENST00000635861 MYCT1Q8N699 235 aa20.03■□□□□ 0.8
CLN3-241ENST00000635861 GPR88Q9GZN0 384 aa20.03■□□□□ 0.8
CLN3-241ENST00000635861 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
CLN3-241ENST00000635861 ZFP14Q9HCL3 533 aa20.03■□□□□ 0.8
CLN3-241ENST00000635861 LTB4R2Q9NPC1 389 aa20.03■□□□□ 0.8
CLN3-241ENST00000635861 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa20.03■□□□□ 0.8
CLN3-241ENST00000635861 FBXO4Q9UKT5 387 aa20.03■□□□□ 0.8
CLN3-241ENST00000635861 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
CLN3-241ENST00000635861 DMXL1Q9Y485 3027 aa20.03■□□□□ 0.8
CLN3-241ENST00000635861 SP9P0CG40 484 aa20.02■□□□□ 0.8
CLN3-241ENST00000635861 GLULP15104 373 aa20.02■□□□□ 0.8
CLN3-241ENST00000635861 RASSF8Q8NHQ8 419 aa20.02■□□□□ 0.8
CLN3-241ENST00000635861 RAD54LQ92698 747 aa20.02■□□□□ 0.8
CLN3-241ENST00000635861 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa20.02■□□□□ 0.8
CLN3-241ENST00000635861 TRPV5Q9NQA5 729 aa20.02■□□□□ 0.8
CLN3-241ENST00000635861 ASAH2Q9NR71 780 aa20.02■□□□□ 0.8
CLN3-241ENST00000635861 DERAQ9Y315 318 aa20.02■□□□□ 0.8
CLN3-241ENST00000635861 DENND4CQ5VZ89 1909 aa20.02■□□□□ 0.8
CLN3-241ENST00000635861 A0A0B4J269 797 aa20.02■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 TBCAO75347 108 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 KRT18P05783 430 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 TYMPP19971 482 aa20.02■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 TNFSF9P41273 254 aa20.02■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 RPS9P46781 194 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 GTF2BQ00403 316 aa20.02■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 TWF1Q12792 350 aa20.02■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 MYBPC2Q14324 1141 aa20.02■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 UBXN2BQ14CS0 331 aa20.02■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa20.02■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 SPATA1Q5VX52 437 aa20.02■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 USP37Q86T82 979 aa20.02■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 MAP4K3Q8IVH8 894 aa20.02■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa20.02■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 E2F7Q96AV8 911 aa20.02■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 ASB16Q96NS5 453 aa20.02■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 MSTO1Q9BUK6 570 aa20.02■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 CCSER1Q9C0I3 900 aa20.02■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 HSFX1Q9UBD0 423 aa20.02■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 DCHS1Q96JQ0 3298 aa20.01■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 FAM170BA6NMN3 283 aa20.01■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 LACTBL1A8MY62 500 aa20.01■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 PLCG1P19174 1290 aa20.01■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 PDCP20941 246 aa20.01■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 FCARP24071 287 aa20.01■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 GPR17Q13304 367 aa20.01■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 TANGO2Q6ICL3 276 aa20.01■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 DSTYKQ6XUX3 929 aa20.01■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 ZNF852Q6ZMS4 543 aa20.01■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa20.01■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 SMARCD2Q92925 531 aa20.01■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 IRF7Q92985 503 aa20.01■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 CLDN23Q96B33 292 aa20.01■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 ASB7Q9H672 318 aa20.01■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 TRPV4Q9HBA0 871 aa20.01■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 COL4A3Q01955 1670 aa20■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 MAN2B1O00754 1011 aa20■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 LAMTOR5O43504 91 aa20■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 MCM6Q14566 821 aa20■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 FAM78AQ5JUQ0 283 aa20■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 SLFN12LQ6IEE8 588 aa20■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 TPRG1Q6ZUI0 275 aa20■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 KCNG4Q8TDN1 519 aa20■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 HVCN1Q96D96 273 aa20■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 TCEAL4Q96EI5 215 aa20■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 FIZ1Q96SL8 496 aa20■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 IER2Q9BTL4 223 aa20■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa20■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 BRD9Q9H8M2 597 aa20■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 CEP72Q9P209 647 aa20■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 YIPF1Q9Y548 306 aa20■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 ASB3Q9Y575 518 aa20■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 ODC1P11926 461 aa19.99■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 PSMC3P17980 439 aa19.99■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 DDIT3P35638 169 aa19.99■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 CCR2P41597 374 aa19.99■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 SPAG1Q07617 926 aa19.99■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 KARSQ15046 597 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 OVOS1Q6IE37 1185 aa19.99■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 POTEHQ6S545 545 aa19.99■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 LRRC15Q8TF66 581 aa19.99■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 STK17AQ9UEE5 414 aa19.99■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 R4GN57 208 aa19.99■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 CACNA1AO00555 2505 aa19.99■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 SPTLC1O15269 473 aa19.98■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 LRRN2O75325 713 aa19.98■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 FGF19O95750 216 aa19.98■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 EPHB3P54753 998 aa19.98■□□□□ 0.79
CLN3-241ENST00000635861 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.1 ms