RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609454.5

ANKRD54-211, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene ANKRD54, Length 825 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-211ENST00000609454 SRFP11831 508 aa20.78■□□□□ 0.92
ANKRD54-211ENST00000609454 NHLH1Q02575 133 aa20.78■□□□□ 0.92
ANKRD54-211ENST00000609454 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
ANKRD54-211ENST00000609454 OVOS1Q6IE37 1185 aa20.78■□□□□ 0.92
ANKRD54-211ENST00000609454 METTL23Q86XA0 190 aa20.78■□□□□ 0.92
ANKRD54-211ENST00000609454 TCEAL8Q8IYN2 117 aa20.78■□□□□ 0.92
ANKRD54-211ENST00000609454 TMEM130Q8N3G9 435 aa20.78■□□□□ 0.92
ANKRD54-211ENST00000609454 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
ANKRD54-211ENST00000609454 ITFG1Q8TB96 612 aa20.78■□□□□ 0.92
ANKRD54-211ENST00000609454 ING5Q8WYH8 240 aa20.78■□□□□ 0.92
ANKRD54-211ENST00000609454 FGF13Q92913 245 aa20.78■□□□□ 0.92
ANKRD54-211ENST00000609454 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa20.78■□□□□ 0.92
ANKRD54-211ENST00000609454 KCNH3Q9ULD8 1083 aa20.78■□□□□ 0.92
ANKRD54-211ENST00000609454 MAFFQ9ULX9 164 aa20.78■□□□□ 0.92
ANKRD54-211ENST00000609454 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
ANKRD54-211ENST00000609454 C2CD2Q9Y426 696 aa20.78■□□□□ 0.92
ANKRD54-211ENST00000609454 STYXL1Q9Y6J8 313 aa20.78■□□□□ 0.92
ANKRD54-211ENST00000609454 NUMBLQ9Y6R0 609 aa20.78■□□□□ 0.92
ANKRD54-211ENST00000609454 DENND4AQ7Z401 1863 aa20.77■□□□□ 0.92
ANKRD54-211ENST00000609454 OR6C75A6NL08 312 aa20.77■□□□□ 0.92
ANKRD54-211ENST00000609454 ZNF197O14709 1029 aa20.77■□□□□ 0.92
ANKRD54-211ENST00000609454 TBC1D4O60343 1298 aa20.77■□□□□ 0.92
ANKRD54-211ENST00000609454 ADRB2P07550 413 aa20.77■□□□□ 0.92
ANKRD54-211ENST00000609454 LILRA4P59901 499 aa20.77■□□□□ 0.92
ANKRD54-211ENST00000609454 ASIC1P78348 528 aa20.77■□□□□ 0.92
ANKRD54-211ENST00000609454 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
ANKRD54-211ENST00000609454 CYP4A22Q5TCH4 519 aa20.77■□□□□ 0.92
ANKRD54-211ENST00000609454 C9orf57Q5W0N0 161 aa20.77■□□□□ 0.92
ANKRD54-211ENST00000609454 ATL3Q6DD88 541 aa20.77■□□□□ 0.92
ANKRD54-211ENST00000609454 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
ANKRD54-211ENST00000609454 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
ANKRD54-211ENST00000609454 SENP8Q96LD8 212 aa20.77■□□□□ 0.92
ANKRD54-211ENST00000609454 DPP3Q9NY33 737 aa20.77■□□□□ 0.92
ANKRD54-211ENST00000609454 CA14Q9ULX7 337 aa20.77■□□□□ 0.92
ANKRD54-211ENST00000609454 INSL5Q9Y5Q6 135 aa20.77■□□□□ 0.92
ANKRD54-211ENST00000609454 VWA8A3KMH1 1905 aa20.76■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 PPP1R37O75864 691 aa20.76■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 OAZ2O95190 189 aa20.76■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 TYMPP19971 482 aa20.76■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 GARTP22102 1010 aa20.76■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 NUBP1P53384 320 aa20.76■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 KCNA1Q09470 495 aa20.76■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 HTR4Q13639 388 aa20.76■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa20.76■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 PRSS33Q8NF86 280 aa20.76■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 SAAL1Q96ER3 474 aa20.76■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 MCRS1Q96EZ8 462 aa20.76■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 PGLYRP2Q96PD5 576 aa20.76■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 IKZF4Q9H2S9 585 aa20.76■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 PCIF1Q9H4Z3 704 aa20.76■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 WNT16Q9UBV4 365 aa20.76■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 DSEQ9UL01 958 aa20.76■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 MYO10Q9HD67 2058 aa20.75■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 PPEF2O14830 753 aa20.75■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 SEC24AO95486 1093 aa20.75■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 ADSSP30520 456 aa20.75■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 ALDH1A3P47895 512 aa20.75■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 TAF6P49848 677 aa20.75■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 CLCN5P51795 746 aa20.75■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 TWF1Q12792 350 aa20.75■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 PLD1Q13393 1074 aa20.75■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 PARM1Q6UWI2 310 aa20.75■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 NT5DC4Q86YG4 428 aa20.75■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 THEM5Q8N1Q8 247 aa20.75■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 STRA6Q9BX79 667 aa20.75■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 FRMD3A2A2Y4 597 aa20.74■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 GOLGA8IPA6NC78 632 aa20.74■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 GOLGA8JA6NMD2 632 aa20.74■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 ANHXE9PGG2 379 aa20.74■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 CYB561D2O14569 222 aa20.74■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 OR4Q2P0C623 313 aa20.74■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP20.74■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 CASP5P51878 434 aa20.74■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 SV2CQ496J9 727 aa20.74■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 CEP57L1Q8IYX8 460 aa20.74■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 FGF14Q92915 247 aa20.74■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 ZNF560Q96MR9 790 aa20.74■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 RTP3Q9BQQ7 232 aa20.74■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 MAGEF1Q9HAY2 307 aa20.74■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 KBTBD4Q9NVX7 518 aa20.74■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 GDE1Q9NZC3 331 aa20.74■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 PIRO00625 290 aa20.73■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 MYL4P12829 197 aa20.73■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 EPHB3P54753 998 aa20.73■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 MYBPC2Q14324 1141 aa20.73■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 SHC4Q6S5L8 630 aa20.73■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 NPAS3Q8IXF0 933 aa20.73■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 GPR152Q8TDT2 470 aa20.73■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 TRIM9Q9C026 710 aa20.73■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 ASAH2Q9NR71 780 aa20.73■□□□□ 0.91
ANKRD54-211ENST00000609454 PCDHA7Q9UN72 937 aa20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms