RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 TTI2Q6NXR4 508 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 KIAA1586Q9HCI6 787 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 C2orf16Q68DN1 1984 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 TTLL13PA6NNM8 815 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF528Q3MIS6 628 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 HACE1Q8IYU2 909 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 IGSF21Q96ID5 467 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 CDT1Q9H211 546 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 EPS15L1Q9UBC2 864 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 SPTLC1O15269 473 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 OGTO15294 1046 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 NR3C1P04150 777 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 ADSSP30520 456 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF165P49910 485 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 CLCN4P51793 760 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 LMNB2Q03252 620 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 EEF1DP3Q658K8 133 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 ANKRD40Q6AI12 368 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 GPR152Q8TDT2 470 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 RSPH1Q8WYR4 309 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 CEP63Q96MT8 703 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 RTKNQ9BST9 563 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 MSTO1Q9BUK6 570 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 ARHGEF3Q9NR81 526 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 DMAC2Q9NW81 257 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 CETN3O15182 167 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 ADRB1P08588 477 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 NR2F2P24468 414 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 KLRC2P26717 231 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 PTPN14Q15678 1187 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 UBXN11Q5T124 520 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 XXYLT1Q8NBI6 393 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 CBWD1Q9BRT8 395 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 HSPBP1Q9NZL4 362 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 USP20Q9Y2K6 914 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 DCDC2BA2VCK2 349 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 SMTNL1A8MU46 457 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 TISP43B9A030 160 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 IKBKBO14920 756 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 MAPK13O15264 365 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 EXTL3O43909 919 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF623O75123 536 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 GLULP15104 373 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 PMS1P54277 932 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 STX17P56962 302 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 MYL5Q02045 173 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 SPATA1Q5VX52 437 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 GPD1LQ8N335 351 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 PJA1Q8NG27 643 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 KLHL5Q96PQ7 755 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 MKNK1Q9BUB5 465 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 IKZF4Q9H2S9 585 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM105AQ9NUU6 356 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-214ENST00000592483 TRIM49BA6NDI0 452 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 CLIC2O15247 247 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 NPTXRO95502 500 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 GRM5P41594 1212 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 ADAM9Q13443 819 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 CYP26C1Q6V0L0 522 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM200AQ8TCP9 573 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 PGBD4Q96DM1 585 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 FBXO4Q9UKT5 387 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 EXOC3O60645 756 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 GNA14O95837 355 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 CYP2J2P51589 502 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 HAPLN2Q9GZV7 340 aa25.56■■□□□ 1.68
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