RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591762.1

SPHK1-209, Transcript of sphingosine kinase 1, human

TSL 2

Gene SPHK1, Length 2,502 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPHK1-209	ENST00000591762	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		18.86	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	USP37	Q86T82	979 aa		18.86	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		18.86	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	18.86	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	18.86	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		18.86	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	MCM8	Q9UJA3	840 aa		18.86	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	PTPRJ	Q12913	1337 aa		18.86	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	RASGRF2	O14827	1237 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	18.85	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	KRT5	P13647	590 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	OSBP	P22059	807 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	CTNNA2	P26232	953 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	18.85	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	GPC5	P78333	572 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	LRRC14	Q15048	493 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	18.85	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762		A0A0G2JMZ2	1700 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	PODXL	O00592	558 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	ASAP2	O43150	1006 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	CYP11B1	P15538	503 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	18.85	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	CLUL1	Q15846	466 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	TCP11	Q8WWU5	503 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	GPR20	Q99678	358 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	SPOP	O43791	374 aa		18.84	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	PEX5	P50542	639 aa		18.84	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	18.84	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	WLS	Q5T9L3	541 aa		18.84	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	18.84	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		18.84	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		18.84	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		18.84	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		18.84	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	SPATA33	Q96N06	139 aa		18.84	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	18.84	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	HSPA6	P17066	643 aa		18.84	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	GTF2H1	P32780	548 aa		18.84	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	FMO1	Q01740	532 aa		18.84	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	LONRF1	Q17RB8	773 aa		18.84	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		18.84	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	RPAIN	Q86UA6	219 aa		18.84	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	18.84	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	18.84	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		18.84	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	18.84	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	PARP2	Q9UGN5	583 aa		18.84	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	MGRN1	O60291	552 aa		18.83	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	18.83	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	ACSL3	O95573	720 aa		18.83	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	CLTA	P09496	248 aa		18.83	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	RFC5	P40937	340 aa		18.83	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	ZBTB33	Q86T24	672 aa		18.83	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	18.83	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	18.83	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		18.83	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		18.83	■□□□□ 0.61
SPHK1-209	ENST00000591762	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		18.83	■□□□□ 0.6
SPHK1-209	ENST00000591762	RTN2	O75298	545 aa		18.83	■□□□□ 0.6
SPHK1-209	ENST00000591762	GJB1	P08034	283 aa		18.83	■□□□□ 0.6
SPHK1-209	ENST00000591762	POTEJ	P0CG39	1038 aa		18.83	■□□□□ 0.6
SPHK1-209	ENST00000591762	RARA	P10276	462 aa		18.83	■□□□□ 0.6
SPHK1-209	ENST00000591762	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	18.83	■□□□□ 0.6
SPHK1-209	ENST00000591762	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.6
SPHK1-209	ENST00000591762	ITIH4	Q14624	930 aa		18.83	■□□□□ 0.6
SPHK1-209	ENST00000591762	PSMD6	Q15008	389 aa		18.83	■□□□□ 0.6
SPHK1-209	ENST00000591762	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		18.83	■□□□□ 0.6
SPHK1-209	ENST00000591762	CCDC63	Q8NA47	563 aa		18.83	■□□□□ 0.6
SPHK1-209	ENST00000591762	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		18.83	■□□□□ 0.6
SPHK1-209	ENST00000591762	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		18.83	■□□□□ 0.6
SPHK1-209	ENST00000591762	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		18.83	■□□□□ 0.6
SPHK1-209	ENST00000591762	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		18.83	■□□□□ 0.6
SPHK1-209	ENST00000591762	CCDC189	A1A4V9	331 aa		18.82	■□□□□ 0.6
SPHK1-209	ENST00000591762	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		18.82	■□□□□ 0.6
SPHK1-209	ENST00000591762	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	18.82	■□□□□ 0.6
SPHK1-209	ENST00000591762	SLMAP	Q14BN4	828 aa		18.82	■□□□□ 0.6
SPHK1-209	ENST00000591762	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	18.82	■□□□□ 0.6
SPHK1-209	ENST00000591762	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		18.82	■□□□□ 0.6
SPHK1-209	ENST00000591762	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	18.82	■□□□□ 0.6
SPHK1-209	ENST00000591762	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	18.82	■□□□□ 0.6
SPHK1-209	ENST00000591762	TCHP	Q9BT92	498 aa		18.82	■□□□□ 0.6
SPHK1-209	ENST00000591762	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		18.82	■□□□□ 0.6
SPHK1-209	ENST00000591762	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	18.82	■□□□□ 0.6
SPHK1-209	ENST00000591762	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		18.82	■□□□□ 0.6
SPHK1-209	ENST00000591762	ADCY3	O60266	1144 aa		18.82	■□□□□ 0.6
SPHK1-209	ENST00000591762	ATP6V1G2	O95670	118 aa		18.82	■□□□□ 0.6
SPHK1-209	ENST00000591762	HLA-DRA	P01903	254 aa		18.82	■□□□□ 0.6
SPHK1-209	ENST00000591762	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	18.82	■□□□□ 0.6

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