RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591760.5

PTPRS-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, human

TSL 2

Gene PTPRS, Length 478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRS-209	ENST00000591760	MAFF	Q9ULX9	164 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	ANO9	A1A5B4	782 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	PIR	O00625	290 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	27.87	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	LRG1	P02750	347 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	ODC1	P11926	461 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	CPB1	P15086	417 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	TYMP	P19971	482 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	KRT85	P78386	507 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	FBXL6	Q8N531	539 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	HPS3	Q969F9	1004 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	NXPE3	Q969Y0	559 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	DPP3	Q9NY33	737 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	TSC2	P49815	1807 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	LAMP2	P13473	410 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	UNC13D	Q70J99	1090 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	SPATA32	Q96LK8	384 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	OR6C75	A6NL08	312 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	EXTL3	O43909	919 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	NTHL1	P78549	312 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	SENP8	Q96LD8	212 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	KCNH6	Q9H252	994 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	UBE4B	O95155	1302 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	TAF6	P49848	677 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	ADCY1	Q08828	1119 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	GPD1L	Q8N335	351 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	CDH7	Q9ULB5	785 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	SPTLC1	O15269	473 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	SEC24A	O95486	1093 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	BECN1	Q14457	450 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	ZNF560	Q96MR9	790 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	DSE	Q9UL01	958 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PTPRS-209	ENST00000591760	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PTPRS-209	ENST00000591760	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PTPRS-209	ENST00000591760	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PTPRS-209	ENST00000591760	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PTPRS-209	ENST00000591760	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
PTPRS-209	ENST00000591760	SLFN14	P0C7P3	912 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PTPRS-209	ENST00000591760	AFM	P43652	599 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PTPRS-209	ENST00000591760	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
PTPRS-209	ENST00000591760	EHHADH	Q08426	723 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PTPRS-209	ENST00000591760	SV2C	Q496J9	727 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PTPRS-209	ENST00000591760	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PTPRS-209	ENST00000591760	ELMOD1	Q8N336	334 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PTPRS-209	ENST00000591760	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PTPRS-209	ENST00000591760	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
PTPRS-209	ENST00000591760	FGF13	Q92913	245 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PTPRS-209	ENST00000591760	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PTPRS-209	ENST00000591760	TCHH	Q07283	1943 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PTPRS-209	ENST00000591760	SCN1A	P35498	2009 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PTPRS-209	ENST00000591760	ANHX	E9PGG2	379 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PTPRS-209	ENST00000591760	CYP11A1	P05108	521 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PTPRS-209	ENST00000591760	PTPN2	P17706	415 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PTPRS-209	ENST00000591760	CMA1	P23946	247 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PTPRS-209	ENST00000591760	PLA2G5	P39877	138 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PTPRS-209	ENST00000591760	PNPLA4	P41247	253 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PTPRS-209	ENST00000591760	HTR4	Q13639	388 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PTPRS-209	ENST00000591760	MYBPC2	Q14324	1141 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PTPRS-209	ENST00000591760	ITFG1	Q8TB96	612 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PTPRS-209	ENST00000591760	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PTPRS-209	ENST00000591760	FAM122A	Q96E09	287 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PTPRS-209	ENST00000591760	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
PTPRS-209	ENST00000591760	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
PTPRS-209	ENST00000591760	RHO	P08100	348 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PTPRS-209	ENST00000591760	PFKFB1	P16118	471 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PTPRS-209	ENST00000591760	CASP1	P29466	404 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PTPRS-209	ENST00000591760	HOXD13	P35453	343 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PTPRS-209	ENST00000591760	WNT7B	P56706	349 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PTPRS-209	ENST00000591760	CUL4B	Q13620	913 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PTPRS-209	ENST00000591760	METTL23	Q86XA0	190 aa		27.8	■■■□□ 2.04

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