RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 GPR156Q8NFN8 814 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 CLPTM1LQ96KA5 538 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 PPM1MQ96MI6 270 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 SAMD11Q96NU1 681 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 COLEC11Q9BWP8 271 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 C19orf44Q9H6X5 657 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 PNPOQ9NVS9 261 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 HSPBP1Q9NZL4 362 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 PXDNQ92626 1479 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 TNS3Q68CZ2 1445 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM94Q12767 1356 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM171A2A8MVW0 826 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 NCAM2O15394 837 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 PLA2G6O60733 806 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 HMMRO75330 724 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 LRG1P02750 347 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 GCP02774 474 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 HPXP02790 462 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 HOXB7P09629 217 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 DHRS4L1P0CG22 281 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 TYRP14679 529 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 BRAFP15056 766 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 XPAP23025 273 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 SMARCA1P28370 1054 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC7A1P30825 629 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 ARL13BQ3SXY8 428 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 BMP2KLQ5H9B9 411 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 C1orf141Q5JVX7 400 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 ANKRD45Q5TZF3 282 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 CIAPIN1Q6FI81 312 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 ARHGEF25Q86VW2 580 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 PROSER1Q86XN7 944 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 SH2D3CQ8N5H7 860 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 ANKRD44Q8N8A2 993 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP4.83□□□□□ -1.644e-7■□□□□ 10.4
CAPNS1-210ENST00000590211 RAB24Q969Q5 203 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 PEX11GQ96HA9 241 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 MSLNLQ96KJ4 702 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM167AQ96KS9 214 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 MRGPRX4Q96LA9 322 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 UBXN10Q96LJ8 280 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 HIST1H2AJQ99878 128 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 INCENPQ9NQS7 918 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 PRDM7Q9NQW5 492 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 ITM2CQ9NQX7 267 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 GALNT8Q9NY28 637 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 PDP2Q9P2J9 529 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 CPNE7Q9UBL6 633 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 GRHPRQ9UBQ7 328 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 GJD2Q9UKL4 321 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 C5P01031 1676 aa4.83□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 NPHP3Q7Z494 1330 aa4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A1W2PPC4 97 aa4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF839A8K0R7 811 aa4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 NRP2O60462 931 aa4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 CUTAO60888 179 aa4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 GNAI3P08754 354 aa4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 NPR1P16066 1061 aa4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 APEX1P27695 318 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC6A9P48067 706 aa4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 ALDH9A1P49189 494 aa4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 HK2P52789 917 aa4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 CDC42EP1Q00587 391 aa4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 MGAT5Q09328 741 aa4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 TEFQ10587 303 aa4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 KCTD2Q14681 263 aa4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC35G1Q2M3R5 365 aa4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 CEP85Q6P2H3 762 aa4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 SPPL2CQ8IUH8 684 aa4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 GLB1L2Q8IW92 636 aa4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 ATP11CQ8NB49 1132 aa4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 NAXEQ8NCW5 288 aa4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 MRGPRX1Q96LB2 322 aa4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 SOX7Q9BT81 388 aa4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-210ENST00000590211 DCTPP1Q9H773 170 aa4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms