RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589419.1

CCBE1-204, Transcript of collagen and calcium binding EGF domains 1, humanhuman

TSL 4

Gene CCBE1, Length 587 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1-204ENST00000589419 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 SPA17Q15506 151 aa14.84□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 SLC18A3Q16572 532 aa14.84□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 GSTCDQ8NEC7 633 aa14.84□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 DBF4BQ8NFT6 615 aa14.84□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 LPPQ93052 612 aa14.84□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 ZFP42Q96MM3 310 aa14.84□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 ARID3AQ99856 593 aa14.84□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 SYT11Q9BT88 431 aa14.84□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa14.84□□□□□ -0.03
CCBE1-204ENST00000589419 MEIS3P2A8K0S8 358 aa14.83□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 KRT5P13647 590 aa14.83□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 RPL9P32969 192 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 CYP2C18P33260 490 aa14.83□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 USP8P40818 1118 aa14.83□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 TAF6P49848 677 aa14.83□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 PDE6CP51160 858 aa14.83□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 TNNC1P63316 161 aa14.83□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 NAB2Q15742 525 aa14.83□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 WDR72Q3MJ13 1102 aa14.83□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 SV2CQ496J9 727 aa14.83□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 C10orf76Q5T2E6 689 aa14.83□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 CNKSR3Q6P9H4 555 aa14.83□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 GLB1LQ6UWU2 654 aa14.83□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 ZNF662Q6ZS27 426 aa14.83□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 ZNF677Q86XU0 584 aa14.83□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 EPS8L1Q8TE68 723 aa14.83□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa14.83□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 UROC1Q96N76 676 aa14.83□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 DESI2Q9BSY9 194 aa14.83□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 NENFQ9UMX5 172 aa14.83□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa14.83□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 SCN1AP35498 2009 aa14.83□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 TTC3P53804 2025 aa14.82□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 ENPP3O14638 875 aa14.82□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 CYP26A1O43174 497 aa14.82□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 HOXA2O43364 376 aa14.82□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 TIMP1P01033 207 aa14.82□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 PFKMP08237 780 aa14.82□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 CLCN1P35523 988 aa14.82□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 SCNN1GP51170 649 aa14.82□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 CCL23P55773 120 aa14.82□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 INCA1Q0VD86 236 aa14.82□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 SCARA3Q6AZY7 606 aa14.82□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 RNF169Q8NCN4 708 aa14.82□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 ACRBPQ8NEB7 543 aa14.82□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 TET1Q8NFU7 2136 aa14.82□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 URGCPQ8TCY9 931 aa14.82□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 ELMO3Q96BJ8 720 aa14.82□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 SCLYQ96I15 445 aa14.82□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 CISHQ9NSE2 258 aa14.82□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 GDAP2Q9NXN4 497 aa14.82□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 POLIQ9UNA4 740 aa14.82□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 ALPK3Q96L96 1907 aa14.82□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 CEP350Q5VT06 3117 aa14.81□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 FAM163BP0C2L3 166 aa14.81□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 CYP11B1P15538 503 aa14.81□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 VAV2P52735 878 aa14.81□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 CDR2Q01850 454 aa14.81□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 TMEM270Q6UE05 265 aa14.81□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa14.81□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 NPAS4Q8IUM7 802 aa14.81□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 REXO1L1PQ8IX06 675 aa14.81□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 SLC30A5Q8TAD4 765 aa14.81□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 OLIG1Q8TAK6 271 aa14.81□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 AGPAT1Q99943 283 aa14.81□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 KANSL3Q9P2N6 904 aa14.81□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 CENPFP49454 3210 aa14.8□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 A0A087X0T9 212 aa14.8□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP14.8□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 PPEF2O14830 753 aa14.8□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 ZNF263O14978 683 aa14.8□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 EFCAB14O75071 495 aa14.8□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 PAEPP09466 180 aa14.8□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 FAM228BP0C875 321 aa14.8□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 TUSC3Q13454 348 aa14.8□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 NOMO2Q5JPE7 1267 aa14.8□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 CLLU1OSQ5K130 101 aa14.8□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 DPH6Q7L8W6 267 aa14.8□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 LIMS2Q7Z4I7 341 aa14.8□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 KIAA1328Q86T90 577 aa14.8□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 SLC47A2Q86VL8 602 aa14.8□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 GPIHBP1Q8IV16 184 aa14.8□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP14.8□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 TSGA10Q9BZW7 698 aa14.8□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 SMYD3Q9H7B4 428 aa14.8□□□□□ -0.04
CCBE1-204ENST00000589419 RNF19AQ9NV58 838 aa14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51 ms