RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589296.5

CYTH1-209, Transcript of cytohesin 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CYTH1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1-209ENST00000589296 GPD1LQ8N335 351 aa20.08■□□□□ 0.81
CYTH1-209ENST00000589296 SCLT1Q96NL6 688 aa20.08■□□□□ 0.81
CYTH1-209ENST00000589296 CCDC77Q9BR77 488 aa20.08■□□□□ 0.81
CYTH1-209ENST00000589296 SH2D3AQ9BRG2 576 aa20.08■□□□□ 0.81
CYTH1-209ENST00000589296 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
CYTH1-209ENST00000589296 CHST7Q9NS84 486 aa20.08■□□□□ 0.81
CYTH1-209ENST00000589296 O00370 1275 aa20.08■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 CNMDO75829 334 aa20.08■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 ADCY8P40145 1251 aa20.08■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 GTF2A2P52657 109 aa20.08■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 RIPK1Q13546 671 aa20.08■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 FOXP3Q9BZS1 431 aa20.08■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 TMEM150BA6NC51 233 aa20.07■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP20.07■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 CETPP11597 493 aa20.07■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 CHKAP35790 457 aa20.07■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 STXBP2Q15833 593 aa20.07■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 PLA2G4FQ68DD2 849 aa20.07■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 CCDC89Q8N998 374 aa20.07■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 GIMAP7Q8NHV1 300 aa20.07■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 CKAP2Q8WWK9 683 aa20.07■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 KIAA1586Q9HCI6 787 aa20.07■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 LGALS13Q9UHV8 139 aa20.07■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 MROH7Q68CQ1 1323 aa20.07■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 TCP11X1B4DZS4 312 aa20.07■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 PSTPIP1O43586 416 aa20.07■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 NSFP46459 744 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 WDR44Q5JSH3 913 aa20.07■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 LIN9Q5TKA1 542 aa20.07■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa20.07■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 VSTM1Q6UX27 236 aa20.07■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa20.07■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 FAM228AQ86W67 206 aa20.07■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 CEP57Q86XR8 500 aa20.07■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 RELL1Q8IUW5 271 aa20.07■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 ACTL7BQ9Y614 415 aa20.07■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 H0YCG3 227 aa20.06■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 PEX10O60683 326 aa20.06■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 ATP9AO75110 1047 aa20.06■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 PROSCO94903 275 aa20.06■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 CELF2O95319 508 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 ATP6V1G2O95670 118 aa20.06■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 CCNG2Q16589 344 aa20.06■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 ZNF365Q70YC5 407 aa20.06■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 KCNK9Q9NPC2 374 aa20.06■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 MCM8Q9UJA3 840 aa20.06■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 CDH16O75309 829 aa20.05■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 STAT4Q14765 748 aa20.05■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 KYNUQ16719 465 aa20.05■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 CHADLQ6NUI6 762 aa20.05■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 TRIM72Q6ZMU5 477 aa20.05■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 RHOT1Q8IXI2 618 aa20.05■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 CCHCR1Q8TD31 782 aa20.05■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 MGARPQ8TDB4 240 aa20.05■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 SENP7Q9BQF6 1050 aa20.05■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 RBPJLQ9UBG7 517 aa20.05■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 KCNG1Q9UIX4 513 aa20.05■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa20.05■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa20.05■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 BRAFP15056 766 aa20.05■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 RRM1P23921 792 aa20.05■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 CETN2P41208 172 aa20.05■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 RTP1P59025 263 aa20.05■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 LMNB2Q03252 620 aa20.05■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 LRRC14Q15048 493 aa20.05■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 NUGGCQ68CJ6 796 aa20.05■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 SLC39A4Q6P5W5 647 aa20.05■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 ANO5Q75V66 913 aa20.05■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 ATG4AQ8WYN0 398 aa20.05■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 KIFC3Q9BVG8 833 aa20.05■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa20.05■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa20.05■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 NINJ2Q9NZG7 142 aa20.05■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa20.05■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 NFASCO94856 1347 aa20.05■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa20.05■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 DCAF8L1A6NGE4 600 aa20.04■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 CCNE2O96020 404 aa20.04■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 CNTN2Q02246 1040 aa20.04■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa20.04■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 MCPH1Q8NEM0 835 aa20.04■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 GRAMD1AQ96CP6 724 aa20.04■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 VCPIP1Q96JH7 1222 aa20.04■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 NOD2Q9HC29 1040 aa20.04■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 TXNRD2Q9NNW7 524 aa20.04■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 ABCF3Q9NUQ8 709 aa20.04■□□□□ 0.8
CYTH1-209ENST00000589296 A0A1B0GUA9 196 aa20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms