RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 WDR72Q3MJ13 1102 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 C3orf36Q3SXR2 165 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 PARP10Q53GL7 1025 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 PPP4R3AQ6IN85 833 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 KIF6Q6ZMV9 814 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 OTOP2Q7RTS6 562 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 FAM156AQ8NDB6 213 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 KCNN1Q92952 543 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 ZBTB8AQ96BR9 441 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 DYDC2Q96IM9 177 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 SCOCQ9UIL1 159 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 CROTQ9UKG9 612 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 IPPQ9Y573 584 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 FAM171A2A8MVW0 826 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 MYL3P08590 195 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 CAPN2P17655 700 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 EDNRBP24530 442 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 HTR1BP28222 390 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 NF2P35240 595 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 CACNB3P54284 484 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 CXCL9Q07325 125 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 NOMO1Q15155 1222 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 GRAMD4Q6IC98 578 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 DAAM2Q86T65 1068 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 FAM129CQ86XR2 697 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 SPICE1Q8N0Z3 855 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 FNIP1Q8TF40 1166 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 SIGLEC10Q96LC7 697 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 CGRRF1Q99675 332 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 C7orf25Q9BPX7 421 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 DMRT3Q9NQL9 472 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 PHTF1Q9UMS5 762 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 THSD7BQ9C0I4 1608 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 DLEC1Q9Y238 1755 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 MRC1P22897 1456 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 A0A0G2JNJ9 132 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 CAPN8A6NHC0 703 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 H0Y858 1186 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 CYP7B1O75881 506 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 KLHL18O94889 574 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 A1BGP04217 495 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 ALDH2P05091 517 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 MED14OSP0DP75 135 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 GLDCP23378 1020 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 IL12RB1P42701 662 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 AK2P54819 239 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 KIAA2012Q0VF49 1180 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 MAN2A1Q16706 1144 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 SP8Q8IXZ3 490 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 PARD3BQ8TEW8 1205 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 IL17RAQ96F46 866 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 EYA3Q99504 573 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 MYD88Q99836 296 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 B3GNT5Q9BYG0 378 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 Q9UFV3 132 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 TAGLN3Q9UI15 199 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 FBXO10Q9UK96 956 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 RIC1Q4ADV7 1423 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 GOLIM4O00461 696 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 FTLP02792 175 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 KRT1P04264 644 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF28P17035 718 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 ADCY8P40145 1251 aa6.54□□□□□ -1.36
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