RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569224.1

DDX19B-215, Transcript of DEAD-box helicase 19B, human

TSL 2

Gene DDX19B, Length 707 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX19B-215	ENST00000569224	TAF6	P49848	677 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	NLRP12	P59046	1061 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	CREM	Q03060	361 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	BFSP1	Q12934	665 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	MLKL	Q8NB16	471 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	PPM1E	Q8WY54	764 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	ZNF560	Q96MR9	790 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	CEP63	Q96MT8	703 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	TLE6	Q9H808	572 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	10.05	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	MTRR	Q9UBK8	725 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	IKBKB	O14920	756 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	LINC01565	O15544	149 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	NCK2	O43639	380 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	TBC1D4	O60343	1298 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	TBX10	O75333	385 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	TRIM49	P0CI25	452 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	TRIM49C	P0CI26	452 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	TYMP	P19971	482 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	LTBR	P36941	435 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	VAMP7	P51809	220 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	AP3M2	P53677	418 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	STX17	P56962	302 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	RBP5	P82980	135 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	ADAM15	Q13444	863 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	PSMD5	Q16401	504 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	ZACN	Q401N2	412 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	SV2C	Q496J9	727 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	PDXDC1	Q6P996	788 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	CEP57	Q86XR8	500 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	SENP8	Q96LD8	212 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	FNIP2	Q9P278	1114 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	KPNA7	A9QM74	516 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	OAZ2	O95190	189 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	VNN1	O95497	513 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	C1R	P00736	705 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	CYP11A1	P05108	521 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	ADH1A	P07327	375 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	KRT19	P08727	400 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	ODC1	P11926	461 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	KRT13	P13646	458 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	PTMS	P20962	102 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	CA8	P35219	290 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	NDUFV1	P49821	464 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	CLCN4	P51793	760 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	PPP3CA	Q08209	521 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	USP37	Q86T82	979 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	APPL2	Q8NEU8	664 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	CLDND1	Q9NY35	253 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		10.02	□□□□□ -0.8
DDX19B-215	ENST00000569224	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DDX19B-215	ENST00000569224	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
DDX19B-215	ENST00000569224	CYB561D2	O14569	222 aa		10.02	□□□□□ -0.81

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