RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM206	Q9H813	350 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		10.19	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	TRIO	O75962	3097 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	ANO9	A1A5B4	782 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	OR6C75	A6NL08	312 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	PIR	O00625	290 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF197	O14709	1029 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	PPEF2	O14830	753 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	IL18RAP	O95256	599 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	F13A1	P00488	732 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	RHO	P08100	348 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	NFIC	P08651	508 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	TYMP	P19971	482 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	HTR4	Q13639	388 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	ATL3	Q6DD88	541 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	IQCE	Q6IPM2	695 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	SHC4	Q6S5L8	630 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	PARM1	Q6UWI2	310 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	MTSS1L	Q765P7	747 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	SIX5	Q8N196	739 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	IQUB	Q8NA54	791 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	DHX58	Q96C10	678 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	SENP8	Q96LD8	212 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	CORO1B	Q9BR76	489 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	TNMD	Q9H2S6	317 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	DPP3	Q9NY33	737 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	CFAP45	Q9UL16	551 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	C2CD2	Q9Y426	696 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	PLXNA3	P51805	1871 aa		10.18	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	SPTLC1	O15269	473 aa		10.17	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	OR4Q2	P0C623	313 aa		10.17	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	ODC1	P11926	461 aa		10.17	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	NPR3	P17342	541 aa		10.17	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	GART	P22102	1010 aa		10.17	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	ME1	P48163	572 aa		10.17	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	CASP5	P51878	434 aa		10.17	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	GPC5	P78333	572 aa		10.17	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	TCF15	Q12870	199 aa		10.17	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	GPR17	Q13304	367 aa		10.17	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	MYBPC2	Q14324	1141 aa		10.17	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	E2F4	Q16254	413 aa		10.17	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		10.17	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		10.17	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	METTL23	Q86XA0	190 aa		10.17	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		10.17	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		10.17	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		10.17	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	GPR152	Q8TDT2	470 aa		10.17	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	ING5	Q8WYH8	240 aa		10.17	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	FGF14	Q92915	247 aa		10.17	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		10.17	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		10.17	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		10.17	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		10.17	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	GDE1	Q9NZC3	331 aa		10.17	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	MYO10	Q9HD67	2058 aa		10.16	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	KRBA1	A5PL33	1030 aa		10.16	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		10.16	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		10.16	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479		H0Y858	1186 aa		10.16	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	CYB561D2	O14569	222 aa		10.16	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	PI15	O43692	258 aa		10.16	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	EXTL3	O43909	919 aa		10.16	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	MICAL2	O94851	1124 aa		10.16	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	CYP11A1	P05108	521 aa		10.16	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	AOC1	P19801	751 aa		10.16	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	RFX1	P22670	979 aa		10.16	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	ALDH1A3	P47895	512 aa		10.16	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	TAF6	P49848	677 aa		10.16	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	TWF1	Q12792	350 aa		10.16	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	DUSP4	Q13115	394 aa		10.16	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	PLD1	Q13393	1074 aa		10.16	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		10.16	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		10.16	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		10.16	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	SAAL1	Q96ER3	474 aa		10.16	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		10.16	□□□□□ -0.78
KIFC3-231	ENST00000567479	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		10.16	□□□□□ -0.78

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