RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567015.5

UTP4-208, Transcript of UTP4, small subunit processome component, human

TSL 2

Gene UTP4, Length 690 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UTP4-208	ENST00000567015	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	GPD1L	Q8N335	351 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	DPP3	Q9NY33	737 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	TSC2	P49815	1807 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	PRR33	A8MZF0	331 aa		12.8	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	SPTLC1	O15269	473 aa		12.8	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	SYK	P43405	635 aa		12.8	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	AFM	P43652	599 aa		12.8	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	GUCY2F	P51841	1108 aa		12.8	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	ZXDA	P98168	799 aa		12.8	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		12.8	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	ZNF280D	Q6N043	979 aa		12.8	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		12.8	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		12.8	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	FAM212A	Q96EL1	285 aa		12.8	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		12.8	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		12.8	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	CLUH	O75153	1309 aa		12.8	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	ZNF233	A6NK53	670 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	RHOBTB3	O94955	611 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	C8A	P07357	584 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	STK4	Q13043	487 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	GPR17	Q13304	367 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	MYBPC2	Q14324	1141 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	SURF1	Q15526	300 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	PTPN21	Q16825	1174 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	LIN9	Q5TKA1	542 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	SAAL1	Q96ER3	474 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	SENP8	Q96LD8	212 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	DMAC2	Q9NW81	257 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	12.79	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	OR6C75	A6NL08	312 aa		12.78	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	ZNF202	O95125	648 aa		12.78	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	PNPLA4	P41247	253 aa		12.78	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	TAF6	P49848	677 aa		12.78	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	DPYD	Q12882	1025 aa		12.78	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	KCNB1	Q14721	858 aa		12.78	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		12.78	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		12.78	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		12.78	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		12.78	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	FSIP1	Q8NA03	581 aa		12.78	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		12.78	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		12.78	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		12.78	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	SPATA18	Q8TC71	538 aa		12.78	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	NXPE3	Q969Y0	559 aa		12.78	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		12.78	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		12.78	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		12.78	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		12.78	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	INTS13	Q9NVM9	706 aa		12.78	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		12.78	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		12.78	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		12.78	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	DSE	Q9UL01	958 aa		12.78	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		12.78	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	TRIO	O75962	3097 aa		12.78	□□□□□ -0.36
UTP4-208	ENST00000567015	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		12.77	□□□□□ -0.37
UTP4-208	ENST00000567015	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		12.77	□□□□□ -0.37
UTP4-208	ENST00000567015	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		12.77	□□□□□ -0.37
UTP4-208	ENST00000567015	KPNA7	A9QM74	516 aa		12.77	□□□□□ -0.37
UTP4-208	ENST00000567015	ANHX	E9PGG2	379 aa		12.77	□□□□□ -0.37
UTP4-208	ENST00000567015	PDXK	O00764	312 aa		12.77	□□□□□ -0.37
UTP4-208	ENST00000567015	XYLB	O75191	536 aa		12.77	□□□□□ -0.37
UTP4-208	ENST00000567015	MICAL2	O94851	1124 aa		12.77	□□□□□ -0.37
UTP4-208	ENST00000567015	SEC24A	O95486	1093 aa		12.77	□□□□□ -0.37
UTP4-208	ENST00000567015	VNN2	O95498	520 aa		12.77	□□□□□ -0.37
UTP4-208	ENST00000567015	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		12.77	□□□□□ -0.37
UTP4-208	ENST00000567015	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
UTP4-208	ENST00000567015	PSMD6	Q15008	389 aa		12.77	□□□□□ -0.37
UTP4-208	ENST00000567015	NFIL3	Q16649	462 aa		12.77	□□□□□ -0.37
UTP4-208	ENST00000567015	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		12.77	□□□□□ -0.37

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