RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566637.5

CTU2-208, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTU2, Length 1,619 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-208ENST00000566637 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CTU2-208ENST00000566637 RPS6KC1Q96S38 1066 aa22.03■■□□□ 1.12
CTU2-208ENST00000566637 TRAIPQ9BWF2 469 aa22.03■■□□□ 1.12
CTU2-208ENST00000566637 BCO2Q9BYV7 579 aa22.03■■□□□ 1.12
CTU2-208ENST00000566637 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CTU2-208ENST00000566637 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa22.03■■□□□ 1.12
CTU2-208ENST00000566637 CYP3A43Q9HB55 503 aa22.03■■□□□ 1.12
CTU2-208ENST00000566637 CISHQ9NSE2 258 aa22.03■■□□□ 1.12
CTU2-208ENST00000566637 INTUQ9ULD6 942 aa22.03■■□□□ 1.12
CTU2-208ENST00000566637 MACROD2A1Z1Q3 448 aa22.02■■□□□ 1.12
CTU2-208ENST00000566637 CYP3A5P20815 502 aa22.02■■□□□ 1.12
CTU2-208ENST00000566637 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
CTU2-208ENST00000566637 TMEM130Q8N3G9 435 aa22.02■■□□□ 1.12
CTU2-208ENST00000566637 LRRC52Q8N7C0 313 aa22.02■■□□□ 1.12
CTU2-208ENST00000566637 ADAM2Q99965 735 aa22.02■■□□□ 1.12
CTU2-208ENST00000566637 ACP6Q9NPH0 428 aa22.02■■□□□ 1.12
CTU2-208ENST00000566637 GIT1Q9Y2X7 761 aa22.02■■□□□ 1.12
CTU2-208ENST00000566637 MGEA5O60502 916 aa22.02■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 MMEP08473 750 aa22.02■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 WEE2P0C1S8 567 aa22.02■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 CHRNB2P17787 502 aa22.02■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 GNA15P30679 374 aa22.02■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 FMO1Q01740 532 aa22.02■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 SLC35F6Q8N357 371 aa22.02■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 PGBD4Q96DM1 585 aa22.02■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 ZNF560Q96MR9 790 aa22.02■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 WDR24Q96S15 920 aa22.02■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 PACSIN1Q9BY11 444 aa22.02■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 TMCO5BA8MYB1 307 aa22.01■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 ZNF623O75123 536 aa22.01■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 ZNF132P52740 706 aa22.01■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 C9orf57Q5W0N0 161 aa22.01■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 ARMC5Q96C12 935 aa22.01■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 PDCL3Q9H2J4 239 aa22.01■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 SLC38A7Q9NVC3 462 aa22.01■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 DUSP10Q9Y6W6 482 aa22.01■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 BTNL10A8MVZ5 291 aa22■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 TACC1O75410 805 aa22■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 LBX1P52954 281 aa22■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 TTC39CQ8N584 583 aa22■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 ALS2CR12Q96Q35 445 aa22■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 SMYD3Q9H7B4 428 aa22■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 RNF19AQ9NV58 838 aa22■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 A0A0U1RQF3 1178 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 THAP12O43422 761 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 RTN2O75298 545 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 GZMAP12544 262 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 MLH1P40692 756 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 PNPLA4P41247 253 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 RAP1GAPP47736 663 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 GALCP54803 685 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 MBTPS1Q14703 1052 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 RNF169Q8NCN4 708 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 LPPQ93052 612 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 NOX5Q96PH1 765 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 PCDHB18PQ96TA0 734 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 UBN1Q9NPG3 1134 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 ANO9A1A5B4 782 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 PITPNM1O00562 1244 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 PTGESO14684 152 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 MOCS3O95396 460 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 TMEM253P0C7T8 217 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 TRIM72Q6ZMU5 477 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 PALB2Q86YC2 1186 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 ZFP42Q96MM3 310 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 MMS19Q96T76 1030 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 GAD1Q99259 594 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 RSAD1Q9HA92 442 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 HTTP42858 3142 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 CTAGE9A4FU28 777 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 DCDC2CA8MYV0 355 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 CALCAP01258 141 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 AGMOQ6ZNB7 445 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 TRIM58Q8NG06 486 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 FTHL17Q9BXU8 183 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 SDCBP2Q9H190 292 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 RGS18Q9NS28 235 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 TAS2R14Q9NYV8 317 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 ANKRD62A6NC57 917 aa21.97■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 MEIS3P2A8K0S8 358 aa21.97■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 PIRO00625 290 aa21.97■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 PPEF2O14830 753 aa21.97■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 THP07101 528 aa21.97■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 CDH8P55286 799 aa21.97■■□□□ 1.11
CTU2-208ENST00000566637 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms