RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555015.5

SRP54-AS1-202, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3

Gene SRP54-AS1, Length 561 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PER2O15055 1255 aa13.9□□□□□ -0.18
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ADH1AP07327 375 aa13.9□□□□□ -0.18
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CNPP09543 421 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SRGAP2BP0DMP2 458 aa13.9□□□□□ -0.18
SRP54-AS1-202ENST00000555015 EPB41P11171 864 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KRT13P13646 458 aa13.9□□□□□ -0.18
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP13.9□□□□□ -0.18
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NDUFV1P49821 464 aa13.9□□□□□ -0.18
SRP54-AS1-202ENST00000555015 VAMP7P51809 220 aa13.9□□□□□ -0.18
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RBP5P82980 135 aa13.9□□□□□ -0.18
SRP54-AS1-202ENST00000555015 BFSP1Q12934 665 aa13.9□□□□□ -0.18
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PSMD5Q16401 504 aa13.9□□□□□ -0.18
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CTC1Q2NKJ3 1217 aa13.9□□□□□ -0.18
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SV2CQ496J9 727 aa13.9□□□□□ -0.18
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ANKS3Q6ZW76 656 aa13.9□□□□□ -0.18
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa13.9□□□□□ -0.18
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PPFIBP1Q86W92 1011 aa13.9□□□□□ -0.18
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa13.9□□□□□ -0.18
SRP54-AS1-202ENST00000555015 APPL2Q8NEU8 664 aa13.9□□□□□ -0.18
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FAM84AQ96KN4 292 aa13.9□□□□□ -0.18
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CEP63Q96MT8 703 aa13.9□□□□□ -0.18
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KLHL5Q96PQ7 755 aa13.9□□□□□ -0.18
SRP54-AS1-202ENST00000555015 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IGFLR1Q9H665 355 aa13.9□□□□□ -0.18
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DACH1Q9UI36 760 aa13.9□□□□□ -0.18
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SIX4Q9UIU6 781 aa13.9□□□□□ -0.18
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RWDD2AQ9UIY3 292 aa13.9□□□□□ -0.18
SRP54-AS1-202ENST00000555015 COG5Q9UP83 839 aa13.9□□□□□ -0.18
SRP54-AS1-202ENST00000555015 AGAP1Q9UPQ3 857 aa13.9□□□□□ -0.18
SRP54-AS1-202ENST00000555015 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MUC3AQ02505 3323 aa13.9□□□□□ -0.18
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SPTLC1O15269 473 aa13.89□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TEX28O15482 410 aa13.89□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 C1RP00736 705 aa13.89□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KRT19P08727 400 aa13.89□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ODC1P11926 461 aa13.89□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NLRP12P59046 1061 aa13.89□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DLG4P78352 724 aa13.89□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MYO1EQ12965 1108 aa13.89□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KCNC3Q14003 757 aa13.89□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DSTYKQ6XUX3 929 aa13.89□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF516Q92618 1163 aa13.89□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HLA-CQ95604 372 aa13.89□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 BORCS6Q96GS4 357 aa13.89□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CLDND1Q9NY35 253 aa13.89□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MTRRQ9UBK8 725 aa13.89□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 BACE2Q9Y5Z0 518 aa13.89□□□□□ -0.19
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 H7C4K7 107 aa13.88□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GLP2RO95838 553 aa13.88□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TYMPP19971 482 aa13.88□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KLRC2P26717 231 aa13.88□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CLCN4P51793 760 aa13.88□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ADAM15Q13444 863 aa13.88□□□□□ -0.19
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 KLHL40Q2TBA0 621 aa13.88□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DPCR1Q3MIW9 517 aa13.88□□□□□ -0.19
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 C1orf220Q5T0J3 134 aa13.88□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF280DQ6N043 979 aa13.88□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa13.88□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 EEF2KMTQ96G04 330 aa13.88□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SENP8Q96LD8 212 aa13.88□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DSEQ9UL01 958 aa13.88□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa13.88□□□□□ -0.19
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 STX10O60499 249 aa13.87□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OAZ2O95190 189 aa13.87□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 STAU1O95793 577 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 TRIM49P0CI25 452 aa13.87□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TRIM49CP0CI26 452 aa13.87□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GTF2H1P32780 548 aa13.87□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 STX17P56962 302 aa13.87□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 BIRC3Q13489 604 aa13.87□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TRPC3Q13507 836 aa13.87□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZACNQ401N2 412 aa13.87□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa13.87□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FRMD5Q7Z6J6 570 aa13.87□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa13.87□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 VN1R2Q8NFZ6 395 aa13.87□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SLC22A17Q8WUG5 538 aa13.87□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CASP10Q92851 521 aa13.87□□□□□ -0.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HPDLQ96IR7 371 aa13.87□□□□□ -0.19
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