RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552346.1

USP15-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 655 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-218ENST00000552346 TPCN1Q9ULQ1 816 aa6.41□□□□□ -1.38
USP15-218ENST00000552346 RHPN2P1A8MT19 583 aa6.4□□□□□ -1.38
USP15-218ENST00000552346 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
USP15-218ENST00000552346 TMEM127O75204 238 aa6.4□□□□□ -1.38
USP15-218ENST00000552346 IPO13O94829 963 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
USP15-218ENST00000552346 ENDOD1O94919 500 aa6.4□□□□□ -1.38
USP15-218ENST00000552346 RHOBTB3O94955 611 aa6.4□□□□□ -1.38
USP15-218ENST00000552346 JUNP05412 331 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
USP15-218ENST00000552346 CTSSP25774 331 aa6.4□□□□□ -1.38
USP15-218ENST00000552346 CDC42EP1Q00587 391 aa6.4□□□□□ -1.38
USP15-218ENST00000552346 POU5F1BQ06416 359 aa6.4□□□□□ -1.38
USP15-218ENST00000552346 NOGQ13253 232 aa6.4□□□□□ -1.38
USP15-218ENST00000552346 CCDC157Q569K6 752 aa6.4□□□□□ -1.38
USP15-218ENST00000552346 C19orf54Q5BKX5 351 aa6.4□□□□□ -1.38
USP15-218ENST00000552346 C1QL3Q5VWW1 255 aa6.4□□□□□ -1.38
USP15-218ENST00000552346 RHOUQ7L0Q8 258 aa6.4□□□□□ -1.38
USP15-218ENST00000552346 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
USP15-218ENST00000552346 POF1BQ8WVV4 589 aa6.4□□□□□ -1.38
USP15-218ENST00000552346 ANKS1AQ92625 1134 aa6.4□□□□□ -1.38
USP15-218ENST00000552346 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
USP15-218ENST00000552346 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
USP15-218ENST00000552346 CASS4Q9NQ75 786 aa6.4□□□□□ -1.38
USP15-218ENST00000552346 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa6.4□□□□□ -1.38
USP15-218ENST00000552346 NCDNQ9UBB6 729 aa6.4□□□□□ -1.38
USP15-218ENST00000552346 DNAI1Q9UI46 699 aa6.4□□□□□ -1.38
USP15-218ENST00000552346 PADI4Q9UM07 663 aa6.4□□□□□ -1.38
USP15-218ENST00000552346 DAPK3O43293 454 aa6.39□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 AKR1B10O60218 316 aa6.39□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 PIP5K1CO60331 668 aa6.39□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 FSBPO95073 299 aa6.39□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 CD69Q07108 199 aa6.39□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 IZUMO3Q5VZ72 239 aa6.39□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 VRK3Q8IV63 474 aa6.39□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 RHOT1Q8IXI2 618 aa6.39□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 MDGA1Q8NFP4 955 aa6.39□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 PROKR1Q8TCW9 393 aa6.39□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 MRGPRX4Q96LA9 322 aa6.39□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 MLST8Q9BVC4 326 aa6.39□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 ARFGAP3Q9NP61 516 aa6.39□□□□□ -1.39
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USP15-218ENST00000552346 LUZP4Q9P127 313 aa6.39□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 ISM1B1AKI9 464 aa6.38□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 NBNO60934 754 aa6.38□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 LY86O95711 162 aa6.38□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 NUDT3O95989 172 aa6.38□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 RAB39AQ14964 217 aa6.38□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 PTPAQ15257 358 aa6.38□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 LY6G5CQ5SRR4 150 aa6.38□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 IL31RAQ8NI17 732 aa6.38□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 SNX33Q8WV41 574 aa6.38□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 CYFIP2Q96F07 1278 aa6.38□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 CLPTM1LQ96KA5 538 aa6.38□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 MANSC1Q9H8J5 431 aa6.38□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 KIAA1586Q9HCI6 787 aa6.38□□□□□ -1.39
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USP15-218ENST00000552346 TDP1Q9NUW8 608 aa6.38□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 PNPOQ9NVS9 261 aa6.38□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 FZD1Q9UP38 647 aa6.38□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 LRCH1Q9Y2L9 728 aa6.38□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 GRXCR1A8MXD5 290 aa6.37□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 NPHP1O15259 732 aa6.37□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 ABHD16AO95870 558 aa6.37□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 LMNAP02545 664 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 ITGB1P05556 798 aa6.37□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 TYRP14679 529 aa6.37□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP6.37□□□□□ -1.394e-6■■□□□ 12.2
USP15-218ENST00000552346 NR4A1P22736 598 aa6.37□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 TNFSF4P23510 183 aa6.37□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 SLC6A9P48067 706 aa6.37□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 NPEPPSP55786 919 aa6.37□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 ZNF543Q08ER8 600 aa6.37□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 PLS1Q14651 629 aa6.37□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 PRR16Q569H4 304 aa6.37□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 ABHD15Q6UXT9 468 aa6.37□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 Q6ZVL8 140 aa6.37□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 TAS1R1Q7RTX1 841 aa6.37□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa6.37□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 UNC5BQ8IZJ1 945 aa6.37□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 CMTM4Q8IZR5 234 aa6.37□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 CPXCR1Q8N123 301 aa6.37□□□□□ -1.39
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USP15-218ENST00000552346 ST8SIA2Q92186 375 aa6.37□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 SLC35A4Q96G79 324 aa6.37□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 NT5C1BQ96P26 610 aa6.37□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 CRB3Q9BUF7 120 aa6.37□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 ANAPC4Q9UJX5 808 aa6.37□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 PACSIN3Q9UKS6 424 aa6.37□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 SIK3Q9Y2K2 1263 aa6.37□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
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