RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551594.1

CTDSP2-207, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSP2, Length 900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-207ENST00000551594 SUSD3Q96L08 255 aa20.24■□□□□ 0.83
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CTDSP2-207ENST00000551594 TTPALQ9BTX7 342 aa20.24■□□□□ 0.83
CTDSP2-207ENST00000551594 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CTDSP2-207ENST00000551594 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CTDSP2-207ENST00000551594 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
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CTDSP2-207ENST00000551594 GNA14O95837 355 aa20.23■□□□□ 0.83
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CTDSP2-207ENST00000551594 TRPC3Q13507 836 aa20.23■□□□□ 0.83
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CTDSP2-207ENST00000551594 ZACNQ401N2 412 aa20.23■□□□□ 0.83
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CTDSP2-207ENST00000551594 STK39Q9UEW8 545 aa20.23■□□□□ 0.83
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CTDSP2-207ENST00000551594 M0QZQ0 153 aa20.22■□□□□ 0.83
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CTDSP2-207ENST00000551594 TCEAL5Q5H9L2 206 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDSP2-207ENST00000551594 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CTDSP2-207ENST00000551594 TRIM59Q8IWR1 403 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDSP2-207ENST00000551594 PPM1EQ8WY54 764 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDSP2-207ENST00000551594 THAP9Q9H5L6 903 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDSP2-207ENST00000551594 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP20.22■□□□□ 0.832e-6■■■■■ 149.1
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CTDSP2-207ENST00000551594 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDSP2-207ENST00000551594 EYSQ5T1H1 3165 aa20.21■□□□□ 0.83
CTDSP2-207ENST00000551594 CYB561D2O14569 222 aa20.21■□□□□ 0.83
CTDSP2-207ENST00000551594 LRRN2O75325 713 aa20.21■□□□□ 0.83
CTDSP2-207ENST00000551594 HLA-DRAP01903 254 aa20.21■□□□□ 0.83
CTDSP2-207ENST00000551594 GTF2H1P32780 548 aa20.21■□□□□ 0.83
CTDSP2-207ENST00000551594 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP20.21■□□□□ 0.83
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CTDSP2-207ENST00000551594 CBWD5Q5RIA9 395 aa20.21■□□□□ 0.83
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CTDSP2-207ENST00000551594 TAS1R2Q8TE23 839 aa20.21■□□□□ 0.83
CTDSP2-207ENST00000551594 XYLT2Q9H1B5 865 aa20.21■□□□□ 0.83
CTDSP2-207ENST00000551594 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CTDSP2-207ENST00000551594 IGFLR1Q9H665 355 aa20.21■□□□□ 0.83
CTDSP2-207ENST00000551594 TMEM8AQ9HCN3 771 aa20.21■□□□□ 0.83
CTDSP2-207ENST00000551594 SYN3O14994 580 aa20.2■□□□□ 0.82
CTDSP2-207ENST00000551594 STX10O60499 249 aa20.2■□□□□ 0.82
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CTDSP2-207ENST00000551594 MXI1P50539 228 aa20.2■□□□□ 0.82
CTDSP2-207ENST00000551594 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CTDSP2-207ENST00000551594 KRT39Q6A163 491 aa20.2■□□□□ 0.82
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CTDSP2-207ENST00000551594 AOPEPQ8N6M6 819 aa20.2■□□□□ 0.82
CTDSP2-207ENST00000551594 PI4K2AQ9BTU6 479 aa20.2■□□□□ 0.82
CTDSP2-207ENST00000551594 TLE6Q9H808 572 aa20.2■□□□□ 0.82
CTDSP2-207ENST00000551594 FANCLQ9NW38 375 aa20.2■□□□□ 0.82
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CTDSP2-207ENST00000551594 IRAK3Q9Y616 596 aa20.2■□□□□ 0.82
CTDSP2-207ENST00000551594 TSC2P49815 1807 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDSP2-207ENST00000551594 CLSTN1O94985 981 aa20.19■□□□□ 0.82
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CTDSP2-207ENST00000551594 PSMD5Q16401 504 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDSP2-207ENST00000551594 SPOPLQ6IQ16 392 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDSP2-207ENST00000551594 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
CTDSP2-207ENST00000551594 APPL2Q8NEU8 664 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDSP2-207ENST00000551594 PIK3R5Q8WYR1 880 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDSP2-207ENST00000551594 SEMA4DQ92854 862 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDSP2-207ENST00000551594 KLHL5Q96PQ7 755 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDSP2-207ENST00000551594 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CTDSP2-207ENST00000551594 RXFP1Q9HBX9 757 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDSP2-207ENST00000551594 POLIQ9UNA4 740 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDSP2-207ENST00000551594 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.82
CTDSP2-207ENST00000551594 TEX28O15482 410 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDSP2-207ENST00000551594 ADAM12O43184 909 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDSP2-207ENST00000551594 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
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