RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550376.5

PRDM4-205, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRDM4, Length 2,591 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-205ENST00000550376 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PRDM4-205ENST00000550376 RUFY4Q6ZNE9 571 aa22.35■■□□□ 1.17
PRDM4-205ENST00000550376 SAPCD2Q86UD0 394 aa22.35■■□□□ 1.17
PRDM4-205ENST00000550376 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PRDM4-205ENST00000550376 GDF3Q9NR23 364 aa22.35■■□□□ 1.17
PRDM4-205ENST00000550376 ZEB2O60315 1214 aa22.35■■□□□ 1.17
PRDM4-205ENST00000550376 ERLIN2O94905 339 aa22.35■■□□□ 1.17
PRDM4-205ENST00000550376 MON1BQ7L1V2 547 aa22.35■■□□□ 1.17
PRDM4-205ENST00000550376 TLK2Q86UE8 772 aa22.35■■□□□ 1.17
PRDM4-205ENST00000550376 IFT20Q8IY31 132 aa22.35■■□□□ 1.17
PRDM4-205ENST00000550376 CD101Q93033 1021 aa22.35■■□□□ 1.17
PRDM4-205ENST00000550376 FAM81BQ96LP2 452 aa22.35■■□□□ 1.17
PRDM4-205ENST00000550376 OSMRQ99650 979 aa22.35■■□□□ 1.17
PRDM4-205ENST00000550376 NFKBIZQ9BYH8 718 aa22.35■■□□□ 1.17
PRDM4-205ENST00000550376 CARD9Q9H257 536 aa22.35■■□□□ 1.17
PRDM4-205ENST00000550376 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
PRDM4-205ENST00000550376 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa22.34■■□□□ 1.17
PRDM4-205ENST00000550376 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa22.34■■□□□ 1.17
PRDM4-205ENST00000550376 CENPCQ03188 943 aa22.34■■□□□ 1.17
PRDM4-205ENST00000550376 UBR7Q8N806 425 aa22.34■■□□□ 1.17
PRDM4-205ENST00000550376 KAT6AQ92794 2004 aa22.34■■□□□ 1.17
PRDM4-205ENST00000550376 MTA2O94776 668 aa22.34■■□□□ 1.17
PRDM4-205ENST00000550376 CTGFP29279 349 aa22.34■■□□□ 1.17
PRDM4-205ENST00000550376 AP3M2P53677 418 aa22.34■■□□□ 1.17
PRDM4-205ENST00000550376 TCEAL1Q15170 157 aa22.34■■□□□ 1.17
PRDM4-205ENST00000550376 UBL4BQ8N7F7 174 aa22.34■■□□□ 1.17
PRDM4-205ENST00000550376 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PRDM4-205ENST00000550376 TRIM51Q9BSJ1 452 aa22.34■■□□□ 1.17
PRDM4-205ENST00000550376 SDCBP2Q9H190 292 aa22.34■■□□□ 1.17
PRDM4-205ENST00000550376 UVRAGQ9P2Y5 699 aa22.34■■□□□ 1.17
PRDM4-205ENST00000550376 HMGXB4Q9UGU5 601 aa22.34■■□□□ 1.17
PRDM4-205ENST00000550376 CNTN6Q9UQ52 1028 aa22.34■■□□□ 1.17
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF132P52740 706 aa22.33■■□□□ 1.17
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF677Q86XU0 584 aa22.33■■□□□ 1.17
PRDM4-205ENST00000550376 SMYD3Q9H7B4 428 aa22.33■■□□□ 1.17
PRDM4-205ENST00000550376 A6NJR5 290 aa22.33■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 CHADLQ6NUI6 762 aa22.33■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 RPS6KC1Q96S38 1066 aa22.33■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 USTQ9Y2C2 406 aa22.33■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 MYL3P08590 195 aa22.32■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 GGCXP38435 758 aa22.32■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP22.32■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 FAM187BQ17R55 369 aa22.32■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 DPH6Q7L8W6 267 aa22.32■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 IFNL1Q8IU54 200 aa22.32■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 DNAJB3Q8WWF6 145 aa22.32■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 DPH5Q9H2P9 285 aa22.32■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 SLC5A4Q9NY91 659 aa22.32■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 MCF2P10911 925 aa22.32■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 CD19P15391 556 aa22.32■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 GJC1P36383 396 aa22.32■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
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PRDM4-205ENST00000550376 SURF1Q15526 300 aa22.32■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 RGMBQ6NW40 437 aa22.32■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 C17orf99Q6UX52 265 aa22.32■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 C18orf8Q96DM3 657 aa22.32■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 TWNKQ96RR1 684 aa22.32■■□□□ 1.16
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PRDM4-205ENST00000550376 NEUROG2Q9H2A3 272 aa22.32■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 TJP2Q9UDY2 1190 aa22.32■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 DAPK3O43293 454 aa22.31■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 CYP4A22Q5TCH4 519 aa22.31■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 WDTC1Q8N5D0 677 aa22.31■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 VPS18Q9P253 973 aa22.31■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 FAN1Q9Y2M0 1017 aa22.31■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 A0A1B0GUA9 196 aa22.31■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 MYO1FO00160 1098 aa22.31■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 TREHO43280 583 aa22.31■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 NPTXRO95502 500 aa22.31■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 POU5F1BQ06416 359 aa22.31■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 CRHR2Q13324 411 aa22.31■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 ADAMTS10Q9H324 1103 aa22.31■■□□□ 1.16
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PRDM4-205ENST00000550376 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa22.31■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 COL1A2P08123 1366 aa22.3■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
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PRDM4-205ENST00000550376 PTP4A2Q12974 167 aa22.3■■□□□ 1.16
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PRDM4-205ENST00000550376 TMEM40Q8WWA1 233 aa22.3■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 APOL6Q9BWW8 343 aa22.3■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa22.3■■□□□ 1.16
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PRDM4-205ENST00000550376 SNTG2Q9NY99 539 aa22.3■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 SYF2O95926 243 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 EPHB4P54760 987 aa22.3■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF667Q5HYK9 610 aa22.3■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 GLRA4Q5JXX5 417 aa22.3■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 CXorf38Q8TB03 319 aa22.3■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
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