RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 C7orf25Q9BPX7 421 aa6.07□□□□□ -1.44
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CLSTN3-215ENST00000544584 GPR88Q9GZN0 384 aa6.07□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 MFSD1Q9H3U5 465 aa6.07□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 KBTBD4Q9NVX7 518 aa6.07□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 MARCH5Q9NX47 278 aa6.07□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 MIOSQ9NXC5 875 aa6.07□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 MTRRQ9UBK8 725 aa6.07□□□□□ -1.44
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CLSTN3-215ENST00000544584 ITGA11Q9UKX5 1188 aa6.07□□□□□ -1.44
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CLSTN3-215ENST00000544584 POLIQ9UNA4 740 aa6.07□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 SORCS3Q9UPU3 1222 aa6.07□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa6.07□□□□□ -1.44
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CLSTN3-215ENST00000544584 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa6.07□□□□□ -1.44
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CLSTN3-215ENST00000544584 A0A1W2PQ64 194 aa6.06□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 A0A1W2PQD8 194 aa6.06□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 FRMD3A2A2Y4 597 aa6.06□□□□□ -1.44
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CLSTN3-215ENST00000544584 HUS1O60921 280 aa6.06□□□□□ -1.44
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CLSTN3-215ENST00000544584 STIM1Q13586 685 aa6.06□□□□□ -1.44
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CLSTN3-215ENST00000544584 TAS1R3Q7RTX0 852 aa6.06□□□□□ -1.44
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CLSTN3-215ENST00000544584 SHDQ96IW2 340 aa6.06□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
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CLSTN3-215ENST00000544584 FAM213AQ9BRX8 229 aa6.06□□□□□ -1.44
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CLSTN3-215ENST00000544584 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa6.06□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 CDY1Q9Y6F8 540 aa6.06□□□□□ -1.44
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CLSTN3-215ENST00000544584 FANCMQ8IYD8 2048 aa6.06□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 FRYLO94915 3013 aa6.06□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 CLUHO75153 1309 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 TTLL13PA6NNM8 815 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 ABLIM1O14639 778 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 CALUO43852 315 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 PHACTR2O75167 634 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 MICAL2O94851 1124 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 CLSTN1O94985 981 aa6.05□□□□□ -1.44
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