RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543190.5

LTBR-211, Transcript of lymphotoxin beta receptor, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LTBR, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBR-211ENST00000543190 OR6C75A6NL08 312 aa20.29■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 SHISA7A6NL88 538 aa20.29■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 TRAK2O60296 914 aa20.29■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 CEBPBP17676 345 aa20.29■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 GPR17Q13304 367 aa20.29■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 MYBPC2Q14324 1141 aa20.29■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 SPATA1Q5VX52 437 aa20.29■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 GPBP1Q86WP2 473 aa20.29■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 ZNF687Q8N1G0 1237 aa20.29■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 ELMOD1Q8N336 334 aa20.29■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 BCO2Q9BYV7 579 aa20.29■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 FOXQ1Q9C009 403 aa20.29■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 CEP72Q9P209 647 aa20.29■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 MOSPD3O75425 235 aa20.28■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 VNN2O95498 520 aa20.28■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 CCR2P41597 374 aa20.28■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 LIG4P49917 911 aa20.28■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 ADCY1Q08828 1119 aa20.28■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 FZD5Q13467 585 aa20.28■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 CUL4AQ13619 759 aa20.28■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 SEZ6Q53EL9 994 aa20.28■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 CYP4A22Q5TCH4 519 aa20.28■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 TANGO2Q6ICL3 276 aa20.28■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 IQCEQ6IPM2 695 aa20.28■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 ADSSL1Q8N142 457 aa20.28■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 RAD54LQ92698 747 aa20.28■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 E2F7Q96AV8 911 aa20.28■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 IER2Q9BTL4 223 aa20.28■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 LRRC3Q9BY71 257 aa20.28■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 ASB7Q9H672 318 aa20.28■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 ZFP14Q9HCL3 533 aa20.28■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 C2CD2Q9Y426 696 aa20.28■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 COL4A3Q01955 1670 aa20.28■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa20.27■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 ANO9A1A5B4 782 aa20.27■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 LACTBL1A8MY62 500 aa20.27■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 NCAM2O15394 837 aa20.27■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 CYP11A1P05108 521 aa20.27■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 HARSP12081 509 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 PLCG1P19174 1290 aa20.27■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 DDIT3P35638 169 aa20.27■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 TNFSF9P41273 254 aa20.27■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 LILRA4P59901 499 aa20.27■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 PLD1Q13393 1074 aa20.27■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 FAM78AQ5JUQ0 283 aa20.27■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa20.27■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 SLC39A4Q6P5W5 647 aa20.27■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa20.27■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 ING5Q8WYH8 240 aa20.27■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 SMARCD2Q92925 531 aa20.27■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 HVCN1Q96D96 273 aa20.27■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 MCRS1Q96EZ8 462 aa20.27■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 KIF12Q96FN5 646 aa20.27■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 PLIN2Q99541 437 aa20.27■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 CORO1BQ9BR76 489 aa20.27■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa20.27■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 ASB3Q9Y575 518 aa20.27■□□□□ 0.84
LTBR-211ENST00000543190 WEE1P30291 646 aa20.26■□□□□ 0.83
LTBR-211ENST00000543190 SLFN12LQ6IEE8 588 aa20.26■□□□□ 0.83
LTBR-211ENST00000543190 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa20.26■□□□□ 0.83
LTBR-211ENST00000543190 ERMP1Q7Z2K6 904 aa20.26■□□□□ 0.83
LTBR-211ENST00000543190 MYCT1Q8N699 235 aa20.26■□□□□ 0.83
LTBR-211ENST00000543190 IRF7Q92985 503 aa20.26■□□□□ 0.83
LTBR-211ENST00000543190 TCEAL4Q96EI5 215 aa20.26■□□□□ 0.83
LTBR-211ENST00000543190 BICD1Q96G01 975 aa20.26■□□□□ 0.83
LTBR-211ENST00000543190 STRA6Q9BX79 667 aa20.26■□□□□ 0.83
LTBR-211ENST00000543190 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
LTBR-211ENST00000543190 STK17AQ9UEE5 414 aa20.26■□□□□ 0.83
LTBR-211ENST00000543190 FAM170BA6NMN3 283 aa20.25■□□□□ 0.83
LTBR-211ENST00000543190 K7ENM7 598 aa20.25■□□□□ 0.83
LTBR-211ENST00000543190 PIRO00625 290 aa20.25■□□□□ 0.83
LTBR-211ENST00000543190 MAN2B1O00754 1011 aa20.25■□□□□ 0.83
LTBR-211ENST00000543190 SPTLC1O15269 473 aa20.25■□□□□ 0.83
LTBR-211ENST00000543190 PPP1R37O75864 691 aa20.25■□□□□ 0.83
LTBR-211ENST00000543190 FAM13AO94988 1023 aa20.25■□□□□ 0.83
LTBR-211ENST00000543190 CPB1P15086 417 aa20.25■□□□□ 0.83
LTBR-211ENST00000543190 PSMC3P17980 439 aa20.25■□□□□ 0.83
LTBR-211ENST00000543190 PDCP20941 246 aa20.25■□□□□ 0.83
LTBR-211ENST00000543190 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
LTBR-211ENST00000543190 SPECC1Q5M775 1068 aa20.25■□□□□ 0.83
LTBR-211ENST00000543190 ZNF852Q6ZMS4 543 aa20.25■□□□□ 0.83
LTBR-211ENST00000543190 NT5DC4Q86YG4 428 aa20.25■□□□□ 0.83
LTBR-211ENST00000543190 SUMF1Q8NBK3 374 aa20.25■□□□□ 0.83
LTBR-211ENST00000543190 ZBTB44Q8NCP5 570 aa20.25■□□□□ 0.83
LTBR-211ENST00000543190 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
LTBR-211ENST00000543190 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
LTBR-211ENST00000543190 ASAH2Q9NR71 780 aa20.25■□□□□ 0.83
LTBR-211ENST00000543190 SEL1LQ9UBV2 794 aa20.25■□□□□ 0.83
LTBR-211ENST00000543190 YIPF1Q9Y548 306 aa20.25■□□□□ 0.83
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