RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 PALB2Q86YC2 1186 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 OR5B17Q8NGF7 314 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 CXorf38Q8TB03 319 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 FNBP1Q96RU3 617 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 S1PR5Q9H228 398 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 MAN1C1Q9NR34 630 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 LMBRD1Q9NUN5 540 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 XIRP2A4UGR9 3374 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 H7C4K7 107 aa20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 ADAM12O43184 909 aa20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 TGM5O43548 720 aa20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 TNNC2P02585 160 aa20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 DLATP10515 647 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 NR2F2P24468 414 aa20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 PNPLA4P41247 253 aa20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 CASP4P49662 377 aa20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 DUOXA2Q1HG44 320 aa20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 EDRF1Q3B7T1 1238 aa20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 SV2CQ496J9 727 aa20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF280DQ6N043 979 aa20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 LILRA6Q6PI73 481 aa20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC127Q96BQ5 260 aa20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 SENP8Q96LD8 212 aa20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 SFXN1Q9H9B4 322 aa20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 DPP7Q9UHL4 492 aa20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 AGAP1Q9UPQ3 857 aa20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 CDY1Q9Y6F8 540 aa20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 ARHGEF37A1IGU5 675 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 MAPK13O15264 365 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 TBC1D4O60343 1298 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 ODC1P11926 461 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 TNNI1P19237 187 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 TYMPP19971 482 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 RPL13P26373 211 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 OR1D2P34982 312 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 RAB33AQ14088 237 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 CEP135Q66GS9 1140 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 ISM2Q6H9L7 571 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 CENPPQ6IPU0 288 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC8B1Q6J4K2 584 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 ADSSL1Q8N142 457 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 LRRC52Q8N7C0 313 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 PLEKHO2Q8TD55 490 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 HDAC7Q8WUI4 952 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 APOL5Q9BWW9 433 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 SIX4Q9UIU6 781 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 FBXW11Q9UKB1 542 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 SPDYE4A6NLX3 237 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 OAZ2O95190 189 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 KRT19P08727 400 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 PPP1R2P41236 205 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 RBP5P82980 135 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 ITIH3Q06033 890 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 STIM1Q13586 685 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 MORC3Q14149 939 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 CAMK4Q16566 473 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 CTXN3Q4LDR2 81 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 PARD3BQ8TEW8 1205 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 SUSD6Q92537 303 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 BORCS6Q96GS4 357 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 ADAM7Q9H2U9 754 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 FBXL5Q9UKA1 691 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 NCOR1O75376 2440 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 KPNA7A9QM74 516 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 CYP11A1P05108 521 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 SPATA31D3P0C874 917 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 BMP6P22004 513 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 ROR1Q01973 937 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 SCARA3Q6AZY7 606 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 CES5AQ6NT32 575 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 USP37Q86T82 979 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 KREMEN2Q8NCW0 462 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF516Q92618 1163 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 KIAA1468Q9P260 1216 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 DSEQ9UL01 958 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 GOLGA6L22H0YM25 854 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 BIN1O00499 593 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 CYB561D2O14569 222 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 PSMA7O14818 248 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 AKAP3O75969 853 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 CLDN10P78369 228 aa20.48■□□□□ 0.87
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