RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522928.1

CLVS1-209, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-209ENST00000522928 HSFX1Q9UBD0 423 aa4.96□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 FZD1Q9UP38 647 aa4.96□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa4.96□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 MYO3AQ8NEV4 1616 aa4.96□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 AGLP35573 1532 aa4.96□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 ITSN2Q9NZM3 1697 aa4.96□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 MLH3Q9UHC1 1453 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 F2RL2O00254 374 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 GRM6O15303 877 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 FZD7O75084 574 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 ZFPL1O95159 310 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 CFIP05156 583 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 ITGB1P05556 798 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 NCLP19338 710 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 MALP21145 153 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 MGAT1P26572 445 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 ATAT1Q5SQI0 421 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 TSHZ3Q63HK5 1081 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 B3GNT9Q6UX72 402 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 VRK3Q8IV63 474 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 TPH2Q8IWU9 490 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 NACC2Q96BF6 587 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 PHACTR3Q96KR7 559 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 ZSWIM1Q9BR11 485 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 ANLNQ9NQW6 1124 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 NPATQ14207 1427 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 REREQ9P2R6 1566 aa4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 AATKQ6ZMQ8 1374 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 MROH2AA6NES4 1674 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 CDHR4A6H8M9 788 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 TEX33O43247 280 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 SLC43A1O75387 559 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 NDUFA10O95299 355 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 PF4V1P10720 104 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 RAB39AQ14964 217 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 LDLRAD3Q86YD5 345 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 FAM90A1Q86YD7 464 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 ULK2Q8IYT8 1036 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 MIER2Q8N344 545 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 HPS3Q969F9 1004 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 LRIG1Q96JA1 1093 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 CAMKK2Q96RR4 588 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 USP25Q9UHP3 1055 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 FMN1Q68DA7 1419 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 PLA2R1Q13018 1463 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 SHANK2Q9UPX8 1470 aa4.94□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 ABCC1P33527 1531 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 COL4A3Q01955 1670 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 A0A1B0GTW7 788 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 GAGE12BA1L429 117 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 GRID2IPA4D2P6 1211 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 GAGE12HA6NDE8 117 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 DIRC3C9JPN6 131 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 IL33O95760 270 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 ALDH2P05091 517 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 FCER1AP12319 257 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 LPOP22079 712 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 FGFR4P22455 802 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 AKAP5P24588 427 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 BMPR1AP36894 532 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 MAP2K6P52564 334 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 HK3P52790 923 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 EPHB1P54762 984 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 PTPRKQ15262 1439 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 TTC7BQ86TV6 843 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 RSPH3Q86UC2 560 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 PLBD2Q8NHP8 589 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 HAS1Q92839 578 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 TLR10Q9BXR5 811 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 A2ML1A8K2U0 1454 aa4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 CPS1P31327 1500 aa4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
CLVS1-209ENST00000522928 E9PLN8 166 aa4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms