RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516876.1

RNU6-928P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 928, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-928P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-928P-201ENST00000516876 NPPBP16860 134 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 ERVFRD-1P60508 538 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 AP2B1P63010 937 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 ARF1P84077 181 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 ATP8B2P98198 1209 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 CD83Q01151 205 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 PTH1RQ03431 593 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 SP140Q13342 867 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 MYBPC2Q14324 1141 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 RAB3GAP1Q15042 981 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 ANKRD1Q15327 319 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 INSCQ1MX18 579 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 NBPF8Q3BBV2 869 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 VWA3BQ502W6 1294 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 CFAP58Q5T655 872 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 MFSD4BQ5TF39 518 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 SULT6B1Q6IMI4 303 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 C16orf54Q6UWD8 224 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 ABHD15Q6UXT9 468 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 Q6ZVL8 140 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 TTC30AQ86WT1 665 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 MICU3Q86XE3 530 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 PPP1R3BQ86XI6 285 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 PDSS2Q86YH6 399 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 NRSN1Q8IZ57 195 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 MPP5Q8N3R9 675 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 TMEM57Q8N5G2 664 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 DTX3Q8N9I9 347 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 USP38Q8NB14 1042 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 IL17RDQ8NFM7 739 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 OR6Y1Q8NGX8 325 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 CPA5Q8WXQ8 436 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 HTRA1Q92743 480 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 SPSB4Q96A44 273 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 CLIC6Q96NY7 704 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 GDF15Q99988 308 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 SDF4Q9BRK5 362 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 SOX7Q9BT81 388 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 PACSIN1Q9BY11 444 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 PDCL3Q9H2J4 239 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 FAM83DQ9H4H8 585 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 GPRC5DQ9NZD1 345 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 AASSQ9UDR5 926 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 Q9UFV3 132 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 EBF1Q9UH73 591 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 SLC5A6Q9Y289 635 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 TMX2Q9Y320 296 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 AQP7P3A6NL99 342 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 EFCAB8A8MWE9 144 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 B4DLN1 442 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 KCNQ3O43525 872 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 COQ9O75208 318 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 WFS1O76024 890 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 ACTL6BO94805 426 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 TBX18O95935 607 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 CHEK2O96017 543 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 AHSGP02765 367 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 HPXP02790 462 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 CD1AP06126 327 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 GAAP10253 952 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 RARBP10826 455 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 ALAS1P13196 640 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 ALOX12P18054 663 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 FSTP19883 344 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 RRM1P23921 792 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 COL8A1P27658 744 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 CALRP27797 417 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 GUCY1A2P33402 732 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 HOXD12P35452 270 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 GDNFP39905 211 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 LIFRP42702 1097 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 GATA4P43694 442 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 DCAF7P61962 342 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 NOMO3P69849 1222 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 IL13RA1P78552 427 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 PRR5P85299 388 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 DUSP2Q05923 314 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 CHRNDQ07001 517 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 CTBP1Q13363 440 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 MTM1Q13496 603 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 SLC12A1Q13621 1099 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 LRP8Q14114 963 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 SLC29A2Q14542 456 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-928P-201ENST00000516876 DLGAP5Q15398 846 aa3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms