RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512131.5

SH3BP2-223, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-223	ENST00000512131	DMAC2	Q9NW81	257 aa		18.72	■□□□□ 0.59
SH3BP2-223	ENST00000512131	RMND1	Q9NWS8	449 aa		18.72	■□□□□ 0.59
SH3BP2-223	ENST00000512131	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	18.72	■□□□□ 0.59
SH3BP2-223	ENST00000512131	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		18.72	■□□□□ 0.59
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF233	A6NK53	670 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SH3BP2-223	ENST00000512131	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SH3BP2-223	ENST00000512131	PIR	O00625	290 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SH3BP2-223	ENST00000512131	TRAPPC3	O43617	180 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SH3BP2-223	ENST00000512131	KIF20A	O95235	890 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SH3BP2-223	ENST00000512131	SMC2	O95347	1197 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SH3BP2-223	ENST00000512131	BRCC3	P46736	316 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SH3BP2-223	ENST00000512131	GUCY2F	P51841	1108 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SH3BP2-223	ENST00000512131	ITIH3	Q06033	890 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SH3BP2-223	ENST00000512131	MTMR3	Q13615	1198 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SH3BP2-223	ENST00000512131	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SH3BP2-223	ENST00000512131	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SH3BP2-223	ENST00000512131	CES5A	Q6NT32	575 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SH3BP2-223	ENST00000512131	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SH3BP2-223	ENST00000512131	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SH3BP2-223	ENST00000512131	BEST2	Q8NFU1	509 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SH3BP2-223	ENST00000512131	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	18.71	■□□□□ 0.59
SH3BP2-223	ENST00000512131	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SH3BP2-223	ENST00000512131	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SH3BP2-223	ENST00000512131	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	18.71	■□□□□ 0.59
SH3BP2-223	ENST00000512131	FNIP2	Q9P278	1114 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SH3BP2-223	ENST00000512131	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SH3BP2-223	ENST00000512131	FAM186A	A6NE01	2351 aa		18.71	■□□□□ 0.59
SH3BP2-223	ENST00000512131	C2CD2L	O14523	706 aa		18.7	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	TEX28	O15482	410 aa		18.7	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	18.7	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	C1R	P00736	705 aa		18.7	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	MYBPC2	Q14324	1141 aa		18.7	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	SURF1	Q15526	300 aa		18.7	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	18.7	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	18.7	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	18.7	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	18.7	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	SMARCE1	Q969G3	411 aa		18.7	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	SUSD3	Q96L08	255 aa		18.7	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		18.7	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		18.7	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	VWA8	A3KMH1	1905 aa		18.7	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		18.7	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	PROB1	E7EW31	1015 aa		18.69	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131		I3L4J1	428 aa		18.69	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	PPEF2	O14830	753 aa		18.69	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	SYN3	O14994	580 aa		18.69	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	PAX3	P23760	479 aa		18.69	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	CYP2J2	P51589	502 aa		18.69	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	NFIL3	Q16649	462 aa		18.69	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		18.69	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		18.69	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	PDXDC1	Q6P996	788 aa		18.69	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		18.69	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	CXorf38	Q8TB03	319 aa		18.69	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	18.69	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	DPP3	Q9NY33	737 aa		18.69	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		18.69	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		18.69	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		18.69	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131		M0QZQ0	153 aa		18.68	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	18.68	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	CA8	P35219	290 aa		18.68	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	CLCN4	P51793	760 aa		18.68	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	CREM	Q03060	361 aa		18.68	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	18.68	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	18.68	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	18.68	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	18.68	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		18.68	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		18.68	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	SPTLC1	O15269	473 aa		18.67	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	EXOC3	O60645	756 aa		18.67	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	NR3C1	P04150	777 aa		18.67	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	ADH1A	P07327	375 aa		18.67	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	WEE2	P0C1S8	567 aa		18.67	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	EPCAM	P16422	314 aa		18.67	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	KLRC2	P26717	231 aa		18.67	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	PRCP	P42785	496 aa		18.67	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	MTHFR	P42898	656 aa		18.67	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	LILRA4	P59901	499 aa		18.67	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	CYP24A1	Q07973	514 aa		18.67	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	PSMD6	Q15008	389 aa		18.67	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	PSMD5	Q16401	504 aa		18.67	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	CEP57	Q86XR8	500 aa		18.67	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		18.67	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	18.67	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	BORCS6	Q96GS4	357 aa		18.67	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		18.67	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	INTS13	Q9NVM9	706 aa		18.67	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	MTRR	Q9UBK8	725 aa		18.67	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		18.67	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		18.67	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	PTPRJ	Q12913	1337 aa		18.67	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	TBC1D4	O60343	1298 aa		18.66	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	ASGR2	P07307	311 aa		18.66	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	MCM4	P33991	863 aa		18.66	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	18.66	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	18.66	■□□□□ 0.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	LILRA6	Q6PI73	481 aa		18.66	■□□□□ 0.58

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