RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 EFCAB12Q6NXP0 572 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 PLXDC1Q8IUK5 500 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 OR7D4Q8NG98 312 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 TFAP2CQ92754 450 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 ADAM2Q99965 735 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 SHANK3Q9BYB0 1731 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 KIF1AQ12756 1690 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 DRGXA6NNA5 263 aa6.31□□□□□ -1.4
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PDE4D-217ENST00000509355 CANXP27824 592 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 SOX5P35711 763 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 CDK17Q00537 523 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 STAT4Q14765 748 aa6.31□□□□□ -1.4
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PDE4D-217ENST00000509355 TAF7LQ5H9L4 462 aa6.31□□□□□ -1.4
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PDE4D-217ENST00000509355 REPS2Q8NFH8 660 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 AUTS2Q8WXX7 1259 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 RIOX1Q9H6W3 641 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 SYNPO2LQ9H987 977 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 CYP4F11Q9HBI6 524 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.31□□□□□ -1.4
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PDE4D-217ENST00000509355 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 OVOS2Q6IE36 1432 aa6.31□□□□□ -1.4
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PDE4D-217ENST00000509355 KIAA0232Q92628 1395 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 NRAPQ86VF7 1730 aa6.3□□□□□ -1.4
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PDE4D-217ENST00000509355 AKR1B10O60218 316 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 NDUFA10O95299 355 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 GPR3P46089 330 aa6.3□□□□□ -1.4
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PDE4D-217ENST00000509355 AGAP9Q5VTM2 703 aa6.3□□□□□ -1.4
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PDE4D-217ENST00000509355 CHAC2Q8WUX2 184 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 FATE1Q969F0 183 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 WDR11Q9BZH6 1224 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 CASZ1Q86V15 1759 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 E9PCH4 1651 aa6.3□□□□□ -1.4
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PDE4D-217ENST00000509355 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
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PDE4D-217ENST00000509355 SP140Q13342 867 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 HECTD2Q5U5R9 776 aa6.29□□□□□ -1.4
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PDE4D-217ENST00000509355 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 GREM2Q9H772 168 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 IFT122Q9HBG6 1241 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 POGKQ9P215 609 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 NRXN1Q9ULB1 1477 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 SSH2Q76I76 1423 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 TOMM70O94826 608 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 ELANEP08246 267 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 MTHFD2P13995 350 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 MTNR1BP49286 362 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 SCAPQ12770 1279 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 FAPQ12884 760 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 PTF1AQ7RTS3 328 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 COQ10AQ96MF6 247 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-217ENST00000509355 PIPSLA2A3N6 862 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-217ENST00000509355 K7ESF4 209 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-217ENST00000509355 CFIP05156 583 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-217ENST00000509355 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-217ENST00000509355 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-217ENST00000509355 MCAMP43121 646 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-217ENST00000509355 CHN2P52757 468 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-217ENST00000509355 SCAND1P57086 179 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-217ENST00000509355 ERVK-21P61565 698 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-217ENST00000509355 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-217ENST00000509355 OLFML1Q6UWY5 402 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-217ENST00000509355 RHOT2Q8IXI1 618 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-217ENST00000509355 KLHL11Q9NVR0 708 aa6.27□□□□□ -1.41
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