RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504458.1

SERF1A-204, Transcript of small EDRK-rich factor 1A, human

TSL 4 BASIC

Gene SERF1A, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SERF1A-204	ENST00000504458	HSD17B4	P51659	736 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	PTEN	P60484	403 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	MYL7	Q01449	175 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	CYP4A11	Q02928	519 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	DRP2	Q13474	957 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	RASA3	Q14644	834 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	PLS1	Q14651	629 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	PSME4	Q14997	1843 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	USH1G	Q495M9	461 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	ODR4	Q5SWX8	454 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	DAAM2	Q86T65	1068 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	FAM83A	Q86UY5	434 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	TPH2	Q8IWU9	490 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	RPTOR	Q8N122	1335 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	TTC16	Q8NEE8	873 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	RDM1	Q8NG50	284 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	ARL8A	Q96BM9	186 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	WNK4	Q96J92	1243 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	ACCS	Q96QU6	501 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	EPN3	Q9H201	632 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	ELP3	Q9H9T3	547 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	RGL1	Q9NZL6	768 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	PARP2	Q9UGN5	583 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	CLRN2	A0PK11	232 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	PODXL	O00592	558 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	WNT10B	O00744	389 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	NDUFAB1	O14561	156 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	CLIC2	O15247	247 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	EXOC3	O60645	756 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	PPFIA2	O75334	1257 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	FAM107A	O95990	144 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	CFB	P00751	764 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	GHRH	P01286	108 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	ICAM1	P05362	532 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	PAEP	P09466	180 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	FAM153B	P0C7A2	387 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	PLS3	P13797	630 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	ECHS1	P30084	290 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	CHRNA3	P32297	505 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	GTF2H1	P32780	548 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	LSP1	P33241	339 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	HSD17B3	P37058	310 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	GPC5	P78333	572 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	GTF2B	Q00403	316 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	MAPK7	Q13164	816 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	FAM153C	Q494X1	144 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	USP37	Q86T82	979 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	HOOK3	Q86VS8	718 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	LMO3	Q8TAP4	145 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	P3H4	Q92791	437 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	CENPT	Q96BT3	561 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	ARMC5	Q96C12	935 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	AGPAT1	Q99943	283 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SERF1A-204	ENST00000504458	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		6.62	□□□□□ -1.35

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms