RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496332.5

THBS3-208, Transcript of thrombospondin 3, human

TSL 3

Gene THBS3, Length 839 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
THBS3-208	ENST00000496332	IL18RAP	O95256	599 aa		12.82	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	LRG1	P02750	347 aa		12.82	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	CPB1	P15086	417 aa		12.82	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	GART	P22102	1010 aa		12.82	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	PAX3	P23760	479 aa		12.82	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	PLA2G5	P39877	138 aa		12.82	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	ASIC1	P78348	528 aa		12.82	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		12.82	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		12.82	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	USP37	Q86T82	979 aa		12.82	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		12.82	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	ITFG1	Q8TB96	612 aa		12.82	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		12.82	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		12.82	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		12.82	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	DPP3	Q9NY33	737 aa		12.82	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	CDH7	Q9ULB5	785 aa		12.82	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		12.82	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		12.81	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		12.81	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	TYMP	P19971	482 aa		12.81	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	WNT7B	P56706	349 aa		12.81	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	ADCY1	Q08828	1119 aa		12.81	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		12.81	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		12.81	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		12.81	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		12.81	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	FGF13	Q92913	245 aa		12.81	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	NXPE3	Q969Y0	559 aa		12.81	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	SENP8	Q96LD8	212 aa		12.81	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	KCNH6	Q9H252	994 aa		12.81	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		12.81	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		12.81	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		12.81	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		12.81	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		12.81	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		12.81	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	OR6C75	A6NL08	312 aa		12.8	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	ANHX	E9PGG2	379 aa		12.8	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	EXTL3	O43909	919 aa		12.8	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	OR4Q2	P0C623	313 aa		12.8	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	ODC1	P11926	461 aa		12.8	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	PTPN2	P17706	415 aa		12.8	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	CASP1	P29466	404 aa		12.8	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	HOXD13	P35453	343 aa		12.8	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	TAF6	P49848	677 aa		12.8	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	HTR4	Q13639	388 aa		12.8	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		12.8	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	IER5L	Q5T953	404 aa		12.8	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		12.8	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		12.8	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		12.8	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		12.8	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		12.8	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	MAFF	Q9ULX9	164 aa		12.8	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		12.8	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	MYO10	Q9HD67	2058 aa		12.79	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	CYB561D2	O14569	222 aa		12.79	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	RHO	P08100	348 aa		12.79	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	AVPR2	P30518	371 aa		12.79	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	AFM	P43652	599 aa		12.79	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	TWF1	Q12792	350 aa		12.79	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	GPR17	Q13304	367 aa		12.79	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	CUL4B	Q13620	913 aa		12.79	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		12.79	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	PARM1	Q6UWI2	310 aa		12.79	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	UNC13D	Q70J99	1090 aa		12.79	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		12.79	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		12.79	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		12.79	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	GPD1L	Q8N335	351 aa		12.79	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	ING5	Q8WYH8	240 aa		12.79	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	FGF14	Q92915	247 aa		12.79	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	SPATA32	Q96LK8	384 aa		12.79	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		12.79	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	CORO1B	Q9BR76	489 aa		12.79	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		12.79	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		12.79	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		12.79	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332		A0A1B0GVL5	298 aa		12.78	□□□□□ -0.36
THBS3-208	ENST00000496332	KPNA7	A9QM74	516 aa		12.78	□□□□□ -0.36

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