RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496183.5

RBM39-241, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 632 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-241ENST00000496183 BMP5P22003 454 aa6.1□□□□□ -1.43
RBM39-241ENST00000496183 SMARCA1P28370 1054 aa6.1□□□□□ -1.43
RBM39-241ENST00000496183 EVA1CP58658 441 aa6.1□□□□□ -1.43
RBM39-241ENST00000496183 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
RBM39-241ENST00000496183 PCSK4Q6UW60 755 aa6.1□□□□□ -1.43
RBM39-241ENST00000496183 ASB10Q8WXI3 467 aa6.1□□□□□ -1.43
RBM39-241ENST00000496183 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.1□□□□□ -1.43
RBM39-241ENST00000496183 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
RBM39-241ENST00000496183 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
RBM39-241ENST00000496183 RIOX1Q9H6W3 641 aa6.1□□□□□ -1.43
RBM39-241ENST00000496183 USP25Q9UHP3 1055 aa6.1□□□□□ -1.43
RBM39-241ENST00000496183 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa6.1□□□□□ -1.43
RBM39-241ENST00000496183 TNKSO95271 1327 aa6.09□□□□□ -1.43
RBM39-241ENST00000496183 WNT10BO00744 389 aa6.09□□□□□ -1.43
RBM39-241ENST00000496183 SLC16A6O15403 523 aa6.09□□□□□ -1.43
RBM39-241ENST00000496183 ESRRBO95718 433 aa6.09□□□□□ -1.43
RBM39-241ENST00000496183 NUDT3O95989 172 aa6.09□□□□□ -1.43
RBM39-241ENST00000496183 ELANEP08246 267 aa6.09□□□□□ -1.43
RBM39-241ENST00000496183 FTH1P19P0C7X4 201 aa6.09□□□□□ -1.43
RBM39-241ENST00000496183 VAV2P52735 878 aa6.09□□□□□ -1.43
RBM39-241ENST00000496183 SEC24CP53992 1094 aa6.09□□□□□ -1.43
RBM39-241ENST00000496183 NOMO3P69849 1222 aa6.09□□□□□ -1.43
RBM39-241ENST00000496183 IL10RAQ13651 578 aa6.09□□□□□ -1.43
RBM39-241ENST00000496183 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
RBM39-241ENST00000496183 NOMO2Q5JPE7 1267 aa6.09□□□□□ -1.43
RBM39-241ENST00000496183 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
RBM39-241ENST00000496183 ZNF365Q70YC5 407 aa6.09□□□□□ -1.43
RBM39-241ENST00000496183 CLNKQ7Z7G1 428 aa6.09□□□□□ -1.43
RBM39-241ENST00000496183 SLC44A3Q8N4M1 653 aa6.09□□□□□ -1.43
RBM39-241ENST00000496183 CHMP4CQ96CF2 233 aa6.09□□□□□ -1.43
RBM39-241ENST00000496183 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
RBM39-241ENST00000496183 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.09□□□□□ -1.43
RBM39-241ENST00000496183 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa6.09□□□□□ -1.43
RBM39-241ENST00000496183 SYBUQ9NX95 663 aa6.09□□□□□ -1.43
RBM39-241ENST00000496183 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
RBM39-241ENST00000496183 LRIT1Q9P2V4 623 aa6.09□□□□□ -1.43
RBM39-241ENST00000496183 MAST3O60307 1309 aa6.08□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 SHROOM2Q13796 1616 aa6.08□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 ZAR1LA6NP61 321 aa6.08□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 FZD9O00144 591 aa6.08□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 AGFG2O95081 481 aa6.08□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 CYP2C19P33261 490 aa6.08□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 TLE1Q04724 770 aa6.08□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 CYP2A13Q16696 494 aa6.08□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 C3orf36Q3SXR2 165 aa6.08□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 C3orf20Q8ND61 904 aa6.08□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 CAGE1Q8TC20 777 aa6.08□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 NELL1Q92832 810 aa6.08□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 RAB24Q969Q5 203 aa6.08□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 MRGPRX4Q96LA9 322 aa6.08□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 HEPHQ9BQS7 1158 aa6.08□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 SIK2Q9H0K1 926 aa6.08□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 RLIMQ9NVW2 624 aa6.08□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 CDYLQ9Y232 598 aa6.08□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 CEP170Q5SW79 1584 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 OVOL3O00110 214 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 SLC43A1O75387 559 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 PRSS23O95084 383 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 IL33O95760 270 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 PROZP22891 400 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 CXCR5P32302 372 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 RPS7P62081 194 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 TMEM240Q5SV17 173 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 GPR149Q86SP6 731 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 KAT5Q92993 513 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 Q96MF0 132 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 KMT5AQ9NQR1 393 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 CFAP97Q9P2B7 532 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 INSL6Q9Y581 213 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 FCER1AP12319 257 aa6.06□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 KCNA2P16389 499 aa6.06□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 EDNRBP24530 442 aa6.06□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 ADRA1BP35368 520 aa6.06□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 FPGSQ05932 587 aa6.06□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 SLFN5Q08AF3 891 aa6.06□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.06□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 SLC4A10Q6U841 1118 aa6.06□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 OLFML1Q6UWY5 402 aa6.06□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 Q6ZNX1 250 aa6.06□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 PDSS2Q86YH6 399 aa6.06□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 SMOQ99835 787 aa6.06□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 BRD9Q9H8M2 597 aa6.06□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 INTS13Q9NVM9 706 aa6.06□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa6.06□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa6.05□□□□□ -1.44
RBM39-241ENST00000496183 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms