RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		6.25	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		6.25	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	USP38	Q8NB14	1042 aa		6.25	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		6.25	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		6.25	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		6.25	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		6.25	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	SHC3	Q92529	594 aa		6.25	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	ALG3	Q92685	438 aa		6.25	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		6.25	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	HES6	Q96HZ4	224 aa		6.25	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		6.25	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	SPATA33	Q96N06	139 aa		6.25	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	KRT12	Q99456	494 aa		6.25	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		6.25	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		6.25	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		6.25	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		6.25	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		6.25	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		6.25	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		6.25	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	INTU	Q9ULD6	942 aa		6.25	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		6.25	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730		A6NJR5	290 aa		6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	KCNK3	O14649	394 aa		6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	P4HA2	O15460	535 aa		6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	CYP26A1	O43174	497 aa		6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	CEP104	O60308	925 aa		6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	PPFIA4	O75335	1185 aa		6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	ERLIN1	O75477	346 aa		6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	MME	P08473	750 aa		6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	KRT13	P13646	458 aa		6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	CAPN2	P17655	700 aa		6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	ARL2	P36404	184 aa		6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	RGS19	P49795	217 aa		6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	CPT1A	P50416	773 aa		6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	MXI1	P50539	228 aa		6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	TUBB4B	P68371	445 aa		6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	EMC2	Q15006	297 aa		6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	TCEAL1	Q15170	157 aa		6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	RPS6KA1	Q15418	735 aa		6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	TAF3	Q5VWG9	929 aa		6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	BRICD5	Q6PL45	260 aa		6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	6.24	□□□□□ -1.41	2e-7	■■■□□ 15.2
C4BPB-208	ENST00000492730	SV2A	Q7L0J3	742 aa		6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	KRT35	Q92764	455 aa		6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	ARL8A	Q96BM9	186 aa		6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	HVCN1	Q96D96	273 aa		6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	CDHR1	Q96JP9	859 aa		6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	BTBD6	Q96KE9	485 aa		6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	ISCU	Q9H1K1	167 aa		6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	PHF24	Q9UPV7	400 aa		6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		6.24	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	EVPL	Q92817	2033 aa		6.23	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730		A0A1W2PQY0	241 aa		6.23	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		6.23	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		6.23	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		6.23	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	CES2	O00748	559 aa		6.23	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	ABLIM1	O14639	778 aa		6.23	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	KPNA6	O60684	536 aa		6.23	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	PHACTR2	O75167	634 aa		6.23	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	PIGR	P01833	764 aa		6.23	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
C4BPB-208	ENST00000492730	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41

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