RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490425.1

NISCH-214, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 5

Gene NISCH, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-214ENST00000490425 PPM1LQ5SGD2 360 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 SCARA3Q6AZY7 606 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 SLC8B1Q6J4K2 584 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 ZNF280DQ6N043 979 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 CCDC149Q6ZUS6 474 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 CBWD2Q8IUF1 395 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 KIAA0895Q8NCT3 520 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 SLC7A14Q8TBB6 771 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 SENP8Q96LD8 212 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 PRKD2Q9BZL6 878 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 DOCK6Q96HP0 2047 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 DENND4AQ7Z401 1863 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 ZNF202O95125 648 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 NTHL1P78549 312 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 BMT2Q1RMZ1 405 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 KRBA2Q6ZNG9 492 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 USP37Q86T82 979 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 RDH13Q8NBN7 331 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 C11orf16Q9NQ32 467 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 LIMD1Q9UGP4 676 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 POLIQ9UNA4 740 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 CLUHO75153 1309 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 PTPRJQ12913 1337 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 ZNF233A6NK53 670 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 ABLIM3O94929 683 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 OAZ2O95190 189 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 PAPLNO95428 1278 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 RPN1P04843 607 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 ITGB3P05106 788 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 ASGR2P07307 311 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 OR4Q2P0C623 313 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 PSMD2Q13200 908 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 OVOS1Q6IE37 1185 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 CYP26C1Q6V0L0 522 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 HS2ST1Q7LGA3 356 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 NT5DC4Q86YG4 428 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 C1orf127Q8N9H9 656 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 ZNF461Q8TAF7 563 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 MTMR12Q9C0I1 747 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 CYP4F11Q9HBI6 524 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 AGAP1Q9UPQ3 857 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 USTQ9Y2C2 406 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 MYO10Q9HD67 2058 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 CYB561D2O14569 222 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 PRRG1O14668 218 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 SEC24AO95486 1093 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 MYL1P05976 194 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP12.97□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 ODC1P11926 461 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 CPB1P15086 417 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 TYMPP19971 482 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 ELF1P32519 619 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 TAF6P49848 677 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 CDR1P51861 262 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 DPYDQ12882 1025 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 TMEM31Q5JXX7 168 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 OTOP3Q7RTS5 596 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 XXYLT1Q8NBI6 393 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 OR5B17Q8NGF7 314 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 BORCS6Q96GS4 357 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 PGLYRP2Q96PD5 576 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 MYADMQ96S97 322 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 TMEM209Q96SK2 561 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 KIAA1586Q9HCI6 787 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 INTS13Q9NVM9 706 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 TECTAO75443 2155 aa12.96□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 GPR37L1O60883 481 aa12.96□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 XYLBO75191 536 aa12.96□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 VNN2O95498 520 aa12.96□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 KRT19P08727 400 aa12.96□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 TMEM191BP0C7N4 346 aa12.96□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 DLATP10515 647 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 ATF2P15336 505 aa12.96□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 ZXDAP98168 799 aa12.96□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 CYP24A1Q07973 514 aa12.96□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 ADCY1Q08828 1119 aa12.96□□□□□ -0.33
NISCH-214ENST00000490425 BFSP1Q12934 665 aa12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms