RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 MSRAQ9UJ68 235 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 CARMIL3Q8ND23 1372 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-211ENST00000484135 TAF1P21675 1872 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 PDE8AO60658 829 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 MCM7P33993 719 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 TUBA3CQ13748 450 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 MAN2A1Q16706 1144 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 TUBA3EQ6PEY2 450 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 OR2W6PQ8NHA6 318 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 NYXQ9GZU5 481 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 PARPBPQ9NWS1 579 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 QSER1Q2KHR3 1735 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 CDHR2Q9BYE9 1310 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 SURF6O75683 361 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 CSF1RP07333 972 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 CHRNA5P30532 468 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 KIR2DL3P43628 341 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 NPEPPSP55786 919 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 FHL2Q14192 279 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 SLC10A5Q5PT55 438 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 FKBP15Q5T1M5 1219 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 Q6ZRM9 215 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF662Q6ZS27 426 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 C11orf74Q86VG3 221 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 TMPRSS6Q8IU80 811 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 MB21D1Q8N884 522 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 CDYL2Q8N8U2 506 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 SMC1BQ8NDV3 1235 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 USP18Q9UMW8 372 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 COL24A1Q17RW2 1714 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 COL4A1P02462 1669 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 MYPNQ86TC9 1320 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 CASZ1Q86V15 1759 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 A0A0G2JLW4 131 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 TGM5O43548 720 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 LSP1P33241 339 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 MAN2A2P49641 1150 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC57Q2TAC2 916 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC152Q4G0S7 254 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 LRRC24Q50LG9 513 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 TAF7LQ5H9L4 462 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 IGFL4Q6B9Z1 124 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 MFSD5Q6N075 450 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 OLFM4Q6UX06 510 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 C2CD5Q86YS7 1000 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 CMTM4Q8IZR5 234 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 SSH3Q8TE77 659 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 OSBPL6Q9BZF3 934 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 SPTLC3Q9NUV7 552 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 HDAC5Q9UQL6 1122 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 LAMB2P55268 1798 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 MYH3P11055 1940 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 LCHNA4D1U4 455 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 SNAP23O00161 211 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 NARSO43776 548 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 MFAP3LO75121 409 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 RAB11FIP3O75154 756 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 HMMRO75330 724 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 TAF5LO75529 589 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 CLSTN1O94985 981 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 DPEP1P16444 411 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 XPAP23025 273 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 LSSP48449 732 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 SCNN1GP51170 649 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-211ENST00000484135 MTX1Q13505 466 aa5.74□□□□□ -1.49
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