RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478603.5

C9orf3-216, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf3, Length 802 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-216ENST00000478603 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa24.78■■□□□ 1.56
C9orf3-216ENST00000478603 HS6ST3Q8IZP7 471 aa24.78■■□□□ 1.56
C9orf3-216ENST00000478603 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
C9orf3-216ENST00000478603 FOXQ1Q9C009 403 aa24.78■■□□□ 1.56
C9orf3-216ENST00000478603 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa24.78■■□□□ 1.56
C9orf3-216ENST00000478603 CEP72Q9P209 647 aa24.78■■□□□ 1.56
C9orf3-216ENST00000478603 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
C9orf3-216ENST00000478603 MIA3Q5JRA6 1907 aa24.78■■□□□ 1.56
C9orf3-216ENST00000478603 TSC2P49815 1807 aa24.77■■□□□ 1.56
C9orf3-216ENST00000478603 ABCD1P33897 745 aa24.77■■□□□ 1.56
C9orf3-216ENST00000478603 NBL1P41271 181 aa24.77■■□□□ 1.56
C9orf3-216ENST00000478603 CCR2P41597 374 aa24.77■■□□□ 1.56
C9orf3-216ENST00000478603 ZNF720Q7Z2F6 126 aa24.77■■□□□ 1.56
C9orf3-216ENST00000478603 FRMD5Q7Z6J6 570 aa24.77■■□□□ 1.56
C9orf3-216ENST00000478603 USP37Q86T82 979 aa24.77■■□□□ 1.56
C9orf3-216ENST00000478603 BEST2Q8NFU1 509 aa24.77■■□□□ 1.56
C9orf3-216ENST00000478603 PGLYRP2Q96PD5 576 aa24.77■■□□□ 1.56
C9orf3-216ENST00000478603 PANK2Q9BZ23 570 aa24.77■■□□□ 1.56
C9orf3-216ENST00000478603 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa24.77■■□□□ 1.56
C9orf3-216ENST00000478603 GDE1Q9NZC3 331 aa24.77■■□□□ 1.56
C9orf3-216ENST00000478603 TBC1D7Q9P0N9 293 aa24.77■■□□□ 1.56
C9orf3-216ENST00000478603 TCHHQ07283 1943 aa24.76■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 PROB1E7EW31 1015 aa24.76■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 VNN2O95498 520 aa24.76■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 TXLNAP40222 546 aa24.76■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 LILRA4P59901 499 aa24.76■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 TMEM132DQ14C87 1099 aa24.76■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 C9orf57Q5W0N0 161 aa24.76■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 SV2BQ7L1I2 683 aa24.76■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 ASCL5Q7RTU5 278 aa24.76■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 CD302Q8IX05 232 aa24.76■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 DNAJC19Q96DA6 116 aa24.76■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 TSPAN18Q96SJ8 248 aa24.76■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 SIT1Q9Y3P8 196 aa24.76■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 STYXL1Q9Y6J8 313 aa24.76■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 MYO15AQ9UKN7 3530 aa24.75■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 A0A087X0B3 334 aa24.75■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 SPTLC1O15269 473 aa24.75■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 LRRN2O75325 713 aa24.75■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 PPP1R37O75864 691 aa24.75■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 STARD6P59095 220 aa24.75■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 KCNA1Q09470 495 aa24.75■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 TANGO2Q6ICL3 276 aa24.75■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 SLFN12LQ6IEE8 588 aa24.75■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 ELMOD1Q8N336 334 aa24.75■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 SENP8Q96LD8 212 aa24.75■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 CRISPLD1Q9H336 500 aa24.75■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 YIPF1Q9Y548 306 aa24.75■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 STX6O43752 255 aa24.74■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 ECI2O75521 394 aa24.74■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 SLC39A14Q15043 492 aa24.74■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 SLC44A4Q53GD3 710 aa24.74■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 OVOS1Q6IE37 1185 aa24.74■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 IQCEQ6IPM2 695 aa24.74■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 POMGNT1Q8WZA1 660 aa24.74■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 TMEM209Q96SK2 561 aa24.74■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 STRA6Q9BX79 667 aa24.74■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa24.74■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 MAFFQ9ULX9 164 aa24.74■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa24.73■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 OR6C75A6NL08 312 aa24.73■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 PIRO00625 290 aa24.73■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 ZNF197O14709 1029 aa24.73■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 MYL4P12829 197 aa24.73■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 GLULP15104 373 aa24.73■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 GJA1P17302 382 aa24.73■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 TYMPP19971 482 aa24.73■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 ADSSP30520 456 aa24.73■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 STAT6P42226 847 aa24.73■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 FAM78AQ5JUQ0 283 aa24.73■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 CYP4A22Q5TCH4 519 aa24.73■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa24.73■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 PJA1Q8NG27 643 aa24.73■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 HVCN1Q96D96 273 aa24.73■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 SHDQ96IW2 340 aa24.73■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 ZSWIM3Q96MP5 696 aa24.73■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 ASB7Q9H672 318 aa24.73■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 DERAQ9Y315 318 aa24.73■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 ANO9A1A5B4 782 aa24.72■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 PRR23AA6NEV1 266 aa24.72■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 MOSPD3O75425 235 aa24.72■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 ODC1P11926 461 aa24.72■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 IDEP14735 1019 aa24.72■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 GAP43P17677 238 aa24.72■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 FCARP24071 287 aa24.72■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 CASP5P51878 434 aa24.72■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 DUSP4Q13115 394 aa24.72■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 GPR17Q13304 367 aa24.72■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa24.72■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 ASAH2Q9NR71 780 aa24.72■■□□□ 1.55
C9orf3-216ENST00000478603 SEL1LQ9UBV2 794 aa24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms