RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 LZTS1Q9Y250 596 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.032e-7■■□□□ 13.7
ACTB-210ENST00000477812 I3L4J1 428 aa21.46■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 M0QZQ0 153 aa21.46■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 GRM6O15303 877 aa21.46■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 PHACTR2O75167 634 aa21.46■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 TADA2AO75478 443 aa21.46■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 PAX3P23760 479 aa21.46■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 DNAJB1P25685 340 aa21.46■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 ATICP31939 592 aa21.46■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 PIK3CAP42336 1068 aa21.46■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 COPB1P53618 953 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 CAMK1Q14012 370 aa21.46■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 SV2CQ496J9 727 aa21.46■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 LIMS2Q7Z4I7 341 aa21.46■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 RAB20Q9NX57 234 aa21.46■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 GDAP2Q9NXN4 497 aa21.46■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 NUB1Q9Y5A7 615 aa21.46■■□□□ 1.03
ACTB-210ENST00000477812 VWA8A3KMH1 1905 aa21.45■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 KPNA7A9QM74 516 aa21.45■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 LPXNO60711 386 aa21.45■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 UBE3AQ05086 875 aa21.45■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 TRPC3Q13507 836 aa21.45■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 TAS1R1Q7RTX1 841 aa21.45■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 ELMO3Q96BJ8 720 aa21.45■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 PI4K2AQ9BTU6 479 aa21.45■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa21.45■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 RBSNQ9H1K0 784 aa21.45■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 CHST7Q9NS84 486 aa21.45■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 TSC2P49815 1807 aa21.45■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 SZT2Q5T011 3432 aa21.45■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 LGALS16A8MUM7 142 aa21.44■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa21.44■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 SOD2P04179 222 aa21.44■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 FGFR3P22607 806 aa21.44■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 KRT17Q04695 432 aa21.44■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 MYO1EQ12965 1108 aa21.44■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa21.44■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 ZNF699Q32M78 642 aa21.44■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 GPR153Q6NV75 609 aa21.44■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 GDPD5Q8WTR4 605 aa21.44■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 TAF4BQ92750 862 aa21.44■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 SENP8Q96LD8 212 aa21.44■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 ZBP1Q9H171 429 aa21.44■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 VPS16Q9H269 839 aa21.44■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 PCDHB8Q9UN66 801 aa21.44■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 TRAPPC3O43617 180 aa21.43■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 NOP14P78316 857 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 GPM6BQ13491 265 aa21.43■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 FAM171A1Q5VUB5 890 aa21.43■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 SPOPLQ6IQ16 392 aa21.43■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 VPS52Q8N1B4 723 aa21.43■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa21.43■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 B3GALT6Q96L58 329 aa21.43■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 STK39Q9UEW8 545 aa21.43■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 RFXAPO00287 272 aa21.42■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 FSCN2O14926 492 aa21.42■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 SYN3O14994 580 aa21.42■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 CYP11A1P05108 521 aa21.42■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 TKTP29401 623 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 TPM4P67936 248 aa21.42■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 GRIN2CQ14957 1233 aa21.42■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa21.42■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 RTP2Q5QGT7 225 aa21.42■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa21.42■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 POF1BQ8WVV4 589 aa21.42■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 SNX9Q9Y5X1 595 aa21.42■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 A0A1B0GTH6 734 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 CYB561D2O14569 222 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 LILRB3O75022 631 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 CTSAP10619 480 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 TYMPP19971 482 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 ASPAP45381 313 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.023e-14■■□□□ 11.8
ACTB-210ENST00000477812 ERVFC1P60507 584 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 DSG1Q02413 1049 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 SOWAHAQ2M3V2 549 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 USP41Q3LFD5 358 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 WDR72Q3MJ13 1102 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 ZNF697Q5TEC3 545 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 KIAA0319Q5VV43 1072 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 DSTYKQ6XUX3 929 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 GPR65Q8IYL9 337 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 TOP6BLQ8N6T0 577 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 CRACR2AQ9BSW2 395 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 TTPALQ9BTX7 342 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.028e-9■■■■■ 39.5
ACTB-210ENST00000477812 GCNT4Q9P109 453 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
ACTB-210ENST00000477812 L1RE1Q9UN81 338 aa21.41■■□□□ 1.02
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