RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475959.1

GTPBP1-208, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-208	ENST00000475959	LILRA4	P59901	499 aa		12.03	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		12.03	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF280D	Q6N043	979 aa		12.03	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		12.03	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		12.03	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	BORCS6	Q96GS4	357 aa		12.03	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		12.03	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		12.03	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		12.03	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	SIX4	Q9UIU6	781 aa		12.03	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		12.03	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		12.02	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	SEC24A	O95486	1093 aa		12.02	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	MTHFR	P42898	656 aa		12.02	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	NTHL1	P78549	312 aa		12.02	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		12.02	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	CYP24A1	Q07973	514 aa		12.02	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	RAB33A	Q14088	237 aa		12.02	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCDC142	Q17RM4	750 aa		12.02	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		12.02	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	CES5A	Q6NT32	575 aa		12.02	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	PDXDC1	Q6P996	788 aa		12.02	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	RNF135	Q8IUD6	432 aa		12.02	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	RDH13	Q8NBN7	331 aa		12.02	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		12.02	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	SENP8	Q96LD8	212 aa		12.02	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		12.02	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		12.02	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		12.02	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	COL4A3	Q01955	1670 aa		12.02	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	MYO10	Q9HD67	2058 aa		12.02	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	CLUH	O75153	1309 aa		12.02	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	TECTA	O75443	2155 aa		12.02	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		12.02	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCL16	O15467	120 aa		12.01	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	HCRT	O43612	131 aa		12.01	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	MYL1	P05976	194 aa		12.01	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		12.01	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	ODC1	P11926	461 aa		12.01	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	CASP4	P49662	377 aa		12.01	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	TAF6	P49848	677 aa		12.01	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		12.01	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		12.01	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		12.01	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		12.01	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		12.01	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		12.01	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		12.01	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		12.01	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		12.01	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		12.01	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		12.01	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	INTS13	Q9NVM9	706 aa		12.01	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		12.01	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		12.01	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		12	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF233	A6NK53	670 aa		12	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959		H7C4K7	107 aa		12	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	ABLIM3	O94929	683 aa		12	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	CPB1	P15086	417 aa		12	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	TYMP	P19971	482 aa		12	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	BFSP1	Q12934	665 aa		12	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	PSMD2	Q13200	908 aa		12	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	KCNB1	Q14721	858 aa		12	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	PSMD6	Q15008	389 aa		12	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		12	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		12	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	LIN9	Q5TKA1	542 aa		12	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		12	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		12	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		12	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		12	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	WDR49	Q8IV35	697 aa		12	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	APPL2	Q8NEU8	664 aa		12	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		12	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF516	Q92618	1163 aa		12	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		12	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF560	Q96MR9	790 aa		12	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		12	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		12	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	CGRRF1	Q99675	332 aa		12	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	DMAC2	Q9NW81	257 aa		12	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		12	□□□□□ -0.49
GTPBP1-208	ENST00000475959	L1RE1	Q9UN81	338 aa		12	□□□□□ -0.49

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