RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471759.5

RABGGTB-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 2,137 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-208ENST00000471759 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 MARSP56192 900 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 FCHO2Q0JRZ9 810 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 ST3GAL1Q11201 340 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 PTGDRQ13258 359 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 SP140Q13342 867 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 GIT2Q14161 759 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 TRAPPC3LQ5T215 181 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 NPAS4Q8IUM7 802 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 TSPYL6Q8N831 410 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 MDM1Q8TC05 714 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 CHPT1Q8WUD6 406 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 ECSITQ9BQ95 431 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 RNF38Q9H0F5 515 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 CDH19Q9H159 772 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 DIABLOQ9NR28 239 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 ABHD10Q9NUJ1 306 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 GNPTGQ9UJJ9 305 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 DOLKQ9UPQ8 538 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 HPS5Q9UPZ3 1129 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 NFS1Q9Y697 457 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 A0A0U1RQJ8 604 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 TK2O00142 265 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 SIN3BO75182 1162 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 ALX3O95076 343 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM153BP0C7A2 387 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 SIK1P57059 783 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 TNNC1P63316 161 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 ADAM17P78536 824 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 PRKCEQ02156 737 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 KLHL30Q0D2K2 578 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM153CQ494X1 144 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 VWA3BQ502W6 1294 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 IGSF11Q5DX21 431 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 ALKBH2Q6NS38 261 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 CHADLQ6NUI6 762 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 USP43Q70EL4 1123 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 CNTROBQ8N137 903 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 FITM2Q8N6M3 262 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 SPATA5Q8NB90 893 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC22A8Q8TCC7 542 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 AFG1LQ8WV93 481 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 SCFD1Q8WVM8 642 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 NOX5Q96PH1 765 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 FERD3LQ96RJ6 166 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 SELENOSQ9BQE4 189 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 ISCUQ9H1K1 167 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 IFT22Q9H7X7 185 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 WBP1LQ9NX94 342 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM153AQ9UHL3 310 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 RIMKLBQ9ULI2 386 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 TRIM35Q9UPQ4 493 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 DLEC1Q9Y238 1755 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF831Q5JPB2 1677 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 CLRN2A0PK11 232 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 GRID2IPA4D2P6 1211 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 OR5K4A6NMS3 321 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 MAPK13O15264 365 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 EGFRP00533 1210 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 CAPN1P07384 714 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 PCNAP12004 261 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 ATF6P18850 670 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 PTPN4P29074 926 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 GPD2P43304 727 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 MAPKAPK2P49137 400 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 CHN2P52757 468 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 IRX4P78413 519 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 S100A12P80511 92 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 C19orf57Q0VDD7 668 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 ITPK1Q13572 414 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 DSG2Q14126 1118 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 C6orf163Q5TEZ5 329 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 C4orf50Q6ZRC1 276 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 SCYL3Q8IZE3 742 aa6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms