RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469307.4

PGAP2-215, Transcript of post-GPI attachment to proteins 2, human

TSL 3

Gene PGAP2, Length 798 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PGAP2-215	ENST00000469307	ECI2	O75521	394 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PGAP2-215	ENST00000469307	SEC24A	O95486	1093 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PGAP2-215	ENST00000469307	YEATS4	O95619	227 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PGAP2-215	ENST00000469307	PTPN2	P17706	415 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PGAP2-215	ENST00000469307	GART	P22102	1010 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PGAP2-215	ENST00000469307	NBL1	P41271	181 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PGAP2-215	ENST00000469307	STARD6	P59095	220 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PGAP2-215	ENST00000469307	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
PGAP2-215	ENST00000469307	GPR17	Q13304	367 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PGAP2-215	ENST00000469307	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
PGAP2-215	ENST00000469307	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PGAP2-215	ENST00000469307	JADE1	Q6IE81	842 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PGAP2-215	ENST00000469307	POTEH	Q6S545	545 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PGAP2-215	ENST00000469307	PARM1	Q6UWI2	310 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PGAP2-215	ENST00000469307	SIX5	Q8N196	739 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PGAP2-215	ENST00000469307	TNMD	Q9H2S6	317 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PGAP2-215	ENST00000469307	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PGAP2-215	ENST00000469307	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PGAP2-215	ENST00000469307	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PGAP2-215	ENST00000469307	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PGAP2-215	ENST00000469307	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
PGAP2-215	ENST00000469307	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PGAP2-215	ENST00000469307	ANK1	P16157	1881 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF292	O60281	2723 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF197	O14709	1029 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	IL18RAP	O95256	599 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	LRG1	P02750	347 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	ELF1	P32519	619 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	13.39	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	ATL3	Q6DD88	541 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	ADAL	Q6DHV7	355 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	GPR152	Q8TDT2	470 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	BORCS6	Q96GS4	357 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	ACCS	Q96QU6	501 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	LRRC3	Q9BY71	257 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	TISP43	B9A030	160 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	PRRG1	O14668	218 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	PPEF2	O14830	753 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	SPTLC1	O15269	473 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	SPTLC2	O15270	562 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	PI15	O43692	258 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	MOSPD3	O75425	235 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	NFIC	P08651	508 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	FCAR	P24071	287 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	PRKCQ	Q04759	706 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	SPAG1	Q07617	926 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	KCNA1	Q09470	495 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	SMARCB1	Q12824	385 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	DYM	Q7RTS9	669 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	CXorf38	Q8TB03	319 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	SENP8	Q96LD8	212 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	CEP72	Q9P209	647 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	DSE	Q9UL01	958 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	SCN1A	P35498	2009 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	TSC2	P49815	1807 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	CUTA	O60888	179 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	CFH	P08603	1231 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	ODC1	P11926	461 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	WEE1	P30291	646 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	CCR2	P41597	374 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	STAT6	P42226	847 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	ACOT2	P49753	483 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	GUCY2F	P51841	1108 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	CASP5	P51878	434 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	PFKP	Q01813	784 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	EHHADH	Q08426	723 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	ADCY1	Q08828	1119 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	PLD1	Q13393	1074 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	CENPP	Q6IPU0	288 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	TMC8	Q8IU68	726 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	SPATA18	Q8TC71	538 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	SHD	Q96IW2	340 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	ASB16	Q96NS5	453 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	PHOX2B	Q99453	314 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	TRIM9	Q9C026	710 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PGAP2-215	ENST00000469307	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		13.37	□□□□□ -0.27

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms