RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461653.5

RABGGTB-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 1,702 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-204ENST00000461653 MUM1L1Q5H9M0 696 aa5.71□□□□□ -1.49
RABGGTB-204ENST00000461653 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.49
RABGGTB-204ENST00000461653 AGAP9Q5VTM2 703 aa5.71□□□□□ -1.49
RABGGTB-204ENST00000461653 OLFML1Q6UWY5 402 aa5.71□□□□□ -1.49
RABGGTB-204ENST00000461653 RHOT2Q8IXI1 618 aa5.71□□□□□ -1.49
RABGGTB-204ENST00000461653 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.49
RABGGTB-204ENST00000461653 PQLC1Q8N2U9 271 aa5.71□□□□□ -1.49
RABGGTB-204ENST00000461653 CNTD1Q8N815 330 aa5.71□□□□□ -1.49
RABGGTB-204ENST00000461653 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.49
RABGGTB-204ENST00000461653 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP5.71□□□□□ -1.493e-6■■□□□ 14.2
RABGGTB-204ENST00000461653 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.49
RABGGTB-204ENST00000461653 DMRT3Q9NQL9 472 aa5.71□□□□□ -1.49
RABGGTB-204ENST00000461653 C14orf119Q9NWQ9 140 aa5.71□□□□□ -1.49
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM50BQ9Y247 325 aa5.71□□□□□ -1.49
RABGGTB-204ENST00000461653 PIPSLA2A3N6 862 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 ZAR1LA6NP61 321 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 APAF1O14727 1248 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 NBNO60934 754 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 SPDEFO95238 335 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 RAP2AP10114 183 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 HALP42357 657 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 KCTD2Q14681 263 aa5.71□□□□□ -1.5
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RABGGTB-204ENST00000461653 AFMIDQ63HM1 303 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 CCDC174Q6PII3 467 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 DRC7Q8IY82 874 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 OR56A1Q8NGH5 318 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 ASB10Q8WXI3 467 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 LINC00476Q8WZB0 136 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 CAVIN3Q969G5 261 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 CAMKK2Q96RR4 588 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 LANCL2Q9NS86 450 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa5.71□□□□□ -1.5
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RABGGTB-204ENST00000461653 TIMM44O43615 452 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 CFIP05156 583 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 HKR1P10072 659 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 SRGNP10124 158 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 IL2RBP14784 551 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 HTR3AP46098 478 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 PPP3CAQ08209 521 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 COBLL1Q53SF7 1204 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 ABHD17BQ5VST6 288 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 MED25Q71SY5 747 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 SKAP1Q86WV1 359 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC9A6Q92581 669 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 MRI1Q9BV20 369 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 ADI1Q9BV57 179 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 SYNPO2LQ9H987 977 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 KLHL11Q9NVR0 708 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 MOCS1Q9NZB8 636 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 MROH2BQ7Z745 1585 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 CDKL5O76039 1030 aa5.69□□□□□ -1.5
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RABGGTB-204ENST00000461653 MYBPC2Q14324 1141 aa5.69□□□□□ -1.5
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RABGGTB-204ENST00000461653 TSHZ3Q63HK5 1081 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 PRIMA1Q86XR5 153 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 STON2Q8WXE9 905 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 LDAHQ9H6V9 325 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 PRDM11Q9NQV5 511 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 DNAJC28Q9NX36 388 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 RNF181Q9P0P0 153 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 KIAA0355O15063 1070 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 PRKD3O94806 890 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 ATP5JP18859 108 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 MCCP23508 829 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 GUCY1A2P33402 732 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 MCAMP43121 646 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 GPR3P46089 330 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 MALLQ13021 153 aa5.68□□□□□ -1.5
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RABGGTB-204ENST00000461653 PTPN21Q16825 1174 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 SPDYE7PQ495Y7 208 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 PARD3BQ8TEW8 1205 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 PLCB1Q9NQ66 1216 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 ENDOD1O94919 500 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 ELANEP08246 267 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 ITGAMP11215 1152 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 FBLP22087 321 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-204ENST00000461653 ALDH1A3P47895 512 aa5.68□□□□□ -1.5
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