RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460628.1

PSMD2-209, Transcript of proteasome 26S subunit, non-ATPase 2, human

TSL 2

Gene PSMD2, Length 565 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMD2-209	ENST00000460628	SHD	Q96IW2	340 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	USP28	Q96RU2	1077 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	MAFF	Q9ULX9	164 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	MTMR6	Q9Y217	621 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	YIPF1	Q9Y548	306 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	DMD	P11532	3685 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	PRR23A	A6NEV1	266 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	MYMK	A6NI61	221 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	OR6C75	A6NL08	312 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	ZNF197	O14709	1029 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	SPTLC1	O15269	473 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	VNN2	O95498	520 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	ODC1	P11926	461 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	TYMP	P19971	482 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	FCAR	P24071	287 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	STARD6	P59095	220 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	PFKP	Q01813	784 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	PRKCQ	Q04759	706 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	HVCN1	Q96D96	273 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	BACH2	Q9BYV9	841 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	ASAH2	Q9NR71	780 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	CEP72	Q9P209	647 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	DERA	Q9Y315	318 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	C2CD2	Q9Y426	696 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	ANO9	A1A5B4	782 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	LRRN2	O75325	713 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	MICAL2	O94851	1124 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	MYL4	P12829	197 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	GAP43	P17677	238 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	STAT6	P42226	847 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	EPHA5	P54756	1037 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	LILRA4	P59901	499 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	KCNA1	Q09470	495 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	GPR17	Q13304	367 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	PLD1	Q13393	1074 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	MYBPC2	Q14324	1141 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	SV2B	Q7L1I2	683 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	LEMD2	Q8NC56	503 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	SENP8	Q96LD8	212 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	ASB16	Q96NS5	453 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	STRA6	Q9BX79	667 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	ASB7	Q9H672	318 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628		A0A087X0B3	334 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	MTMR11	A4FU01	709 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	PIR	O00625	290 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	STX6	O43752	255 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	MOSPD3	O75425	235 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	GCNT3	O95395	438 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	CYP11A1	P05108	521 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	GLUL	P15104	373 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	GJA1	P17302	382 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	PAX3	P23760	479 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	ADSS	P30520	456 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	CASP5	P51878	434 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	DUSP4	Q13115	394 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	GRM2	Q14416	872 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	SLC39A14	Q15043	492 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	TEAD2	Q15562	447 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PSMD2-209	ENST00000460628	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79

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