RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456038.5

POLD2-208, Transcript of DNA polymerase delta 2, accessory subunit, human

TSL 3

Gene POLD2, Length 665 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POLD2-208	ENST00000456038	CLIC6	Q96NY7	704 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	GAD1	Q99259	594 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	PLIN2	Q99541	437 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	KXD1	Q9BQD3	176 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	VPS45	Q9NRW7	570 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	HES2	Q9Y543	173 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	CCDC169	A6NNP5	214 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038		K7ERI5	159 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	N4BP3	O15049	544 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	ECI2	O75521	394 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	ZMYND10	O75800	440 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	PRKCB	P05771	671 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	STAT6	P42226	847 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	NPTX2	P47972	431 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	GLUD2	P49448	558 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	SCNN1G	P51170	649 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	PEX3	P56589	373 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	NTHL1	P78549	312 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	MAPK7	Q13164	816 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	USP49	Q70CQ1	688 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	SV2B	Q7L1I2	683 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	PALB2	Q86YC2	1186 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	DAW1	Q8N136	415 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	URGCP	Q8TCY9	931 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	RABGGTA	Q92696	567 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	EDEM2	Q9BV94	578 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	PARVG	Q9HBI0	331 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	IPP	Q9Y573	584 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	ARL5C	A6NH57	179 aa		11.1	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		11.1	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	FAM13A	O94988	1023 aa		11.1	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	MPL	P40238	635 aa		11.1	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	MLH1	P40692	756 aa		11.1	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	ZNF131	P52739	623 aa		11.1	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	STRN3	Q13033	797 aa		11.1	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		11.1	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		11.1	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	ARSH	Q5FYA8	562 aa		11.1	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		11.1	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		11.1	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		11.1	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		11.1	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	IQUB	Q8NA54	791 aa		11.1	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	FAM3C	Q92520	227 aa		11.1	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	SPATA32	Q96LK8	384 aa		11.1	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	REEP2	Q9BRK0	252 aa		11.1	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		11.1	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	TNMD	Q9H2S6	317 aa		11.1	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	11.1	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		11.1	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		11.1	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	VWA8	A3KMH1	1905 aa		11.09	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	C4orf47	A7E2U8	309 aa		11.09	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	ADAM12	O43184	909 aa		11.09	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	11.09	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	RAP1GAP	P47736	663 aa		11.09	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	OR1G1	P47890	313 aa		11.09	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	AMPD3	Q01432	767 aa		11.09	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	LRRC32	Q14392	662 aa		11.09	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	MCM6	Q14566	821 aa		11.09	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	RTP2	Q5QGT7	225 aa		11.09	□□□□□ -0.63
POLD2-208	ENST00000456038	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63

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