RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436404.6

CNGA3-205, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 2,504 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-205ENST00000436404 NMRK1Q9NWW6 199 aa17.89■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 MGAMO43451 1857 aa17.88■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 SIGLEC16A6NMB1 481 aa17.88■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 DHX15O43143 795 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 SKIP12755 728 aa17.88■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 MAGEA8P43361 318 aa17.88■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 MTMR1Q13613 665 aa17.88■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 B3GNT9Q6UX72 402 aa17.88■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF577Q9BSK1 485 aa17.88■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 TIPINQ9BVW5 301 aa17.88■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 LRRC27Q9C0I9 530 aa17.88■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 MLXIPLQ9NP71 852 aa17.88■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 HAO1Q9UJM8 370 aa17.88■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa17.88■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 MARCH6O60337 910 aa17.88■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 SETSIPP0DME0 302 aa17.88■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 STX2P32856 288 aa17.88■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 RASSF2P50749 326 aa17.88■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 LONRF1Q17RB8 773 aa17.88■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 OTOP1Q7RTM1 612 aa17.88■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 TTC8Q8TAM2 541 aa17.88■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 DDX12PQ92771 950 aa17.88■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 PNMA5Q96PV4 448 aa17.88■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 ZWILCHQ9H900 591 aa17.88■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 PCNTO95613 3336 aa17.87■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 ATP9AO75110 1047 aa17.87■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 UCHL3P15374 230 aa17.87■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 TARSP26639 723 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 ADORA2AP29274 412 aa17.87■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 YARSP54577 528 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 HTRA3P83110 453 aa17.87■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 RCN2Q14257 317 aa17.87■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 ABRAQ8N0Z2 381 aa17.87■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 ERP27Q96DN0 273 aa17.87■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 ACTN1P12814 892 aa17.87■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 KRT13P13646 458 aa17.87■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 CHRNA3P32297 505 aa17.87■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 CACNA2D1P54289 1103 aa17.87■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 KCNH2Q12809 1159 aa17.87■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 GRB14Q14449 540 aa17.87■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 ECM1Q16610 540 aa17.87■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF792Q3KQV3 632 aa17.87■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa17.87■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 LRRC8CQ8TDW0 803 aa17.87■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 PTPRN2Q92932 1015 aa17.87■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 GPRASP2Q96D09 838 aa17.87■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa17.87■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 PITPNM3Q9BZ71 974 aa17.87■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa17.87■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 PHF24Q9UPV7 400 aa17.87■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 WDR81Q562E7 1941 aa17.86■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 MAGEA13PA6NCF6 341 aa17.86■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 EML1O00423 815 aa17.86■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 CA12O43570 354 aa17.86■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 PHF2O75151 1096 aa17.86■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 ENTPD5O75356 428 aa17.86■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 GH1P01241 217 aa17.86■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 OCRLQ01968 901 aa17.86■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 PPP2R5CQ13362 524 aa17.86■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 RAD54LQ92698 747 aa17.86■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 LRRC37BQ96QE4 947 aa17.86■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 RAB34Q9BZG1 259 aa17.86■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 PKD2L1Q9P0L9 805 aa17.86■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 PDP2Q9P2J9 529 aa17.86■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 PCYOX1Q9UHG3 505 aa17.86■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 THSD7BQ9C0I4 1608 aa17.86■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 POTEFA5A3E0 1075 aa17.86■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 SMAPO00193 183 aa17.86■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 MAPK13O15264 365 aa17.86■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 STRNO43815 780 aa17.86■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 STAM2O75886 525 aa17.86■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 GSTT1P30711 240 aa17.86■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 MAPK4P31152 587 aa17.86■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 MPP2Q14168 576 aa17.86■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 STXBP2Q15833 593 aa17.86■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa17.86■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 ARHGAP18Q8N392 663 aa17.86■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 C18orf8Q96DM3 657 aa17.86■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 RIT2Q99578 217 aa17.86■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 NDNQ99608 321 aa17.86■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa17.86■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa17.86■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP17.85■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 BRAFP15056 766 aa17.85■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 EPHB2P29323 1055 aa17.85■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 GALCP54803 685 aa17.85■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF568Q3ZCX4 644 aa17.85■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 PLEKHH3Q7Z736 793 aa17.85■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 MORC4Q8TE76 937 aa17.85■□□□□ 0.45
CNGA3-205ENST00000436404 ART4Q93070 314 aa17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 116 ms