RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435576.2

TRABD2B-201, Transcript of TraB domain containing 2B, humanhuman

TSL 3

Gene TRABD2B, Length 619 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABD2B-201ENST00000435576 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
TRABD2B-201ENST00000435576 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
TRABD2B-201ENST00000435576 BORCS6Q96GS4 357 aa14.85□□□□□ -0.03
TRABD2B-201ENST00000435576 MFSD14AQ96MC6 490 aa14.85□□□□□ -0.03
TRABD2B-201ENST00000435576 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
TRABD2B-201ENST00000435576 INTS13Q9NVM9 706 aa14.85□□□□□ -0.03
TRABD2B-201ENST00000435576 SIX4Q9UIU6 781 aa14.85□□□□□ -0.03
TRABD2B-201ENST00000435576 CDH22Q9UJ99 828 aa14.85□□□□□ -0.03
TRABD2B-201ENST00000435576 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
TRABD2B-201ENST00000435576 BACE2Q9Y5Z0 518 aa14.85□□□□□ -0.03
TRABD2B-201ENST00000435576 CALUO43852 315 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
TRABD2B-201ENST00000435576 GLUD1P00367 558 aa14.84□□□□□ -0.03
TRABD2B-201ENST00000435576 ITGB3P05106 788 aa14.84□□□□□ -0.03
TRABD2B-201ENST00000435576 SPATA31D3P0C874 917 aa14.84□□□□□ -0.03
TRABD2B-201ENST00000435576 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
TRABD2B-201ENST00000435576 BMP6P22004 513 aa14.84□□□□□ -0.03
TRABD2B-201ENST00000435576 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
TRABD2B-201ENST00000435576 SURF1Q15526 300 aa14.84□□□□□ -0.03
TRABD2B-201ENST00000435576 NFIL3Q16649 462 aa14.84□□□□□ -0.03
TRABD2B-201ENST00000435576 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
TRABD2B-201ENST00000435576 DSTYKQ6XUX3 929 aa14.84□□□□□ -0.03
TRABD2B-201ENST00000435576 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa14.84□□□□□ -0.03
TRABD2B-201ENST00000435576 WDR49Q8IV35 697 aa14.84□□□□□ -0.03
TRABD2B-201ENST00000435576 SUSD6Q92537 303 aa14.84□□□□□ -0.03
TRABD2B-201ENST00000435576 CCDC127Q96BQ5 260 aa14.84□□□□□ -0.03
TRABD2B-201ENST00000435576 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
TRABD2B-201ENST00000435576 CGRRF1Q99675 332 aa14.84□□□□□ -0.03
TRABD2B-201ENST00000435576 MAN1C1Q9NR34 630 aa14.84□□□□□ -0.03
TRABD2B-201ENST00000435576 LMBRD1Q9NUN5 540 aa14.84□□□□□ -0.03
TRABD2B-201ENST00000435576 AGAP1Q9UPQ3 857 aa14.84□□□□□ -0.03
TRABD2B-201ENST00000435576 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
TRABD2B-201ENST00000435576 CDY1Q9Y6F8 540 aa14.84□□□□□ -0.03
TRABD2B-201ENST00000435576 DENND4AQ7Z401 1863 aa14.83□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 TMEM191BP0C7N4 346 aa14.83□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 DLATP10515 647 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 OR1D2P34982 312 aa14.83□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 TAF6P49848 677 aa14.83□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 RAB33AQ14088 237 aa14.83□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 MYBPC2Q14324 1141 aa14.83□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 CAMK4Q16566 473 aa14.83□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 ADSSL1Q8N142 457 aa14.83□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa14.83□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa14.83□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 ZNF516Q92618 1163 aa14.83□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa14.83□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 SENP8Q96LD8 212 aa14.83□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 DZANK1Q9NVP4 752 aa14.83□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 FBXL5Q9UKA1 691 aa14.83□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 ITGA11Q9UKX5 1188 aa14.83□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 DOCK6Q96HP0 2047 aa14.82□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 OAZ2O95190 189 aa14.82□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 C1RP00736 705 aa14.82□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 WEE2P0C1S8 567 aa14.82□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 CD44P16070 742 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 TYMPP19971 482 aa14.82□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 NR2F2P24468 414 aa14.82□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 PMS1P54277 932 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 DLG4P78352 724 aa14.82□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 MORC3Q14149 939 aa14.82□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 DUOXA2Q1HG44 320 aa14.82□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 CTXN3Q4LDR2 81 aa14.82□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 CEP135Q66GS9 1140 aa14.82□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 CENPPQ6IPU0 288 aa14.82□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 SLC8B1Q6J4K2 584 aa14.82□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 APPL2Q8NEU8 664 aa14.82□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 PARD3BQ8TEW8 1205 aa14.82□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 ZNF560Q96MR9 790 aa14.82□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 FNBP1Q96RU3 617 aa14.82□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 ADAM7Q9H2U9 754 aa14.82□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 SFXN1Q9H9B4 322 aa14.82□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 FBXW11Q9UKB1 542 aa14.82□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 WDR27A2RRH5 827 aa14.81□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 KPNA7A9QM74 516 aa14.81□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 H7C4K7 107 aa14.81□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 BIN1O00499 593 aa14.81□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 CYB561D2O14569 222 aa14.81□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 RFPL2O75678 378 aa14.81□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 AKAP3O75969 853 aa14.81□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 TNNC2P02585 160 aa14.81□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 CYP11A1P05108 521 aa14.81□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 KRT19P08727 400 aa14.81□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 ODC1P11926 461 aa14.81□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 TNNI1P19237 187 aa14.81□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 PAX3P23760 479 aa14.81□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 PNPLA4P41247 253 aa14.81□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 CLDN10P78369 228 aa14.81□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 RBP5P82980 135 aa14.81□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 ROR1Q01973 937 aa14.81□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 EDRF1Q3B7T1 1238 aa14.81□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 SV2CQ496J9 727 aa14.81□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 ANKRD40Q6AI12 368 aa14.81□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 ZNF280DQ6N043 979 aa14.81□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 TMC5Q6UXY8 1006 aa14.81□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa14.81□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 LRRC52Q8N7C0 313 aa14.81□□□□□ -0.04
TRABD2B-201ENST00000435576 KREMEN2Q8NCW0 462 aa14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80 ms