RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430930.5

TNS1-207, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 5,900 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-207ENST00000430930 ITGA4P13612 1032 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 SPRP35270 261 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 SERPINB10P48595 397 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 VSNL1P62760 191 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 TMEM117Q9H0C3 514 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 UNC45AQ9H3U1 944 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 E9PCH4 1651 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 MYL2P10916 166 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 RASA1P20936 1047 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 ACOT2P49753 483 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 GPRASP2Q96D09 838 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 CCDC90BQ9GZT6 254 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 C1orf167Q5SNV9 1468 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 HBP1O60381 514 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 PRR5LQ6MZQ0 368 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 RMDN2Q96LZ7 410 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 FAM47DPA6NHR8 397 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 WASHC5Q12768 1159 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 MTF1Q14872 753 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 SAMD3Q8N6K7 520 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 TNIP2Q8NFZ5 429 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 ARL8AQ96BM9 186 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 NIF3L1Q9GZT8 377 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 RUBCNLQ9H714 662 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 HACL1Q9UJ83 578 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 SUFUQ9UMX1 484 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 CHN1P15882 459 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 KCNK16Q96T55 309 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 PKD2L2Q9NZM6 624 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 SRP72O76094 671 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 SLC30A5Q8TAD4 765 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 DACH2Q96NX9 599 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 RAB6BQ9NRW1 208 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 ERAP1Q9NZ08 941 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 CDYLQ9Y232 598 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 NDUFS3O75489 264 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 SYF2O95926 243 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 HLA-DRAP01903 254 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 APOA4P06727 396 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 POLBP06746 335 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 CYP2C8P10632 490 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 LRRC8BQ6P9F7 803 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 FBXO33Q7Z6M2 555 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 VPS33BQ9H267 617 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 TRPC7Q9HCX4 862 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 APRTP07741 180 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 KLC4Q9NSK0 619 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 FHOD1Q9Y613 1164 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 PTK6Q13882 451 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 USP10Q14694 798 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 C16orf96A6NNT2 1141 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 RPS6KA5O75582 802 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 RALBP11234 206 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 CPT1AP50416 773 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 ICE2Q659A1 982 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 KLHL11Q9NVR0 708 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 SELENONQ9NZV5 590 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 USP32Q8NFA0 1604 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 ZNF185O15231 689 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 ARHGEF9O43307 516 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 GUCY1A3Q02108 690 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 PTK7Q13308 1070 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 LINC00523Q86TU6 105 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 CHP1Q99653 195 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 TRIM51Q9BSJ1 452 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 JMJD4Q9H9V9 463 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 C5orf58C9J3I9 102 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 PDHA1P08559 390 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 MEI1Q5TIA1 1274 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 JAMLQ86YT9 394 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 MS4A14Q96JA4 679 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 ISCUQ9H1K1 167 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP13.71□□□□□ -0.219e-7■■■□□ 18.7
TNS1-207ENST00000430930 PSTPIP1O43586 416 aa13.71□□□□□ -0.21
TNS1-207ENST00000430930 NTSR2O95665 410 aa13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.8 ms