RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429490.5

SGMS1-203, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 3,634 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-203ENST00000429490 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
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SGMS1-203ENST00000429490 MCF2L2Q86YR7 1114 aa14.52□□□□□ -0.09
SGMS1-203ENST00000429490 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.09
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SGMS1-203ENST00000429490 DESP17661 470 aa14.51□□□□□ -0.09
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SGMS1-203ENST00000429490 ORC1Q13415 861 aa14.51□□□□□ -0.09
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SGMS1-203ENST00000429490 ZFATQ9P243 1243 aa14.5□□□□□ -0.09
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SGMS1-203ENST00000429490 FAM198AQ9UFP1 575 aa14.5□□□□□ -0.09
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SGMS1-203ENST00000429490 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa14.49□□□□□ -0.09
SGMS1-203ENST00000429490 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SGMS1-203ENST00000429490 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa14.49□□□□□ -0.09
SGMS1-203ENST00000429490 FAM71AQ8IYT1 594 aa14.49□□□□□ -0.09
SGMS1-203ENST00000429490 CRAMP1Q96RY5 1269 aa14.49□□□□□ -0.09
SGMS1-203ENST00000429490 THTPAQ9BU02 230 aa14.49□□□□□ -0.09
SGMS1-203ENST00000429490 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SGMS1-203ENST00000429490 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SGMS1-203ENST00000429490 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
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