RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428584.5

TTC28-AS1-207, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 5,859 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MAGEA4P43358 317 aa15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 USP10Q14694 798 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DCUN1D1Q96GG9 259 aa15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 AGAP1Q9UPQ3 857 aa15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ITM2BQ9Y287 266 aa15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IL18RAPO95256 599 aa15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GYPCP04921 128 aa15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GRIK1P39086 918 aa15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RAP1GDS1P52306 607 aa15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FBXW4P57775 412 aa15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OR2W6PQ8NHA6 318 aa15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PTPRN2Q92932 1015 aa15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KATNAL1Q9BW62 490 aa15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TASP1Q9H6P5 420 aa15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FLT1P17948 1338 aa15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ADGRB3O60242 1522 aa15.64■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMEM120BA0PK00 339 aa15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DAB1O75553 588 aa15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TRPC1P48995 793 aa15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMEM132DQ14C87 1099 aa15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 THAP11Q96EK4 314 aa15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OTUD5Q96G74 571 aa15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NYAP2Q9P242 653 aa15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PNPLA6Q8IY17 1366 aa15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 STRIP1Q5VSL9 837 aa15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NUDT18Q6ZVK8 323 aa15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MFN1Q8IWA4 741 aa15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMEM8AQ9HCN3 771 aa15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 BLOC1S6Q9UL45 172 aa15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PCDHB8Q9UN66 801 aa15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ENTPD3O75355 529 aa15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 WEE2P0C1S8 567 aa15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 COMTP21964 271 aa15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SPRP35270 261 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RFC5P40937 340 aa15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PLA2G4AP47712 749 aa15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ITGA8P53708 1063 aa15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DMC1Q14565 340 aa15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 UNC13BO14795 1591 aa15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 VCPP55072 806 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SYCP2LQ5T4T6 812 aa15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMEM154Q6P9G4 183 aa15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C9orf72Q96LT7 481 aa15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ERP44Q9BS26 406 aa15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MKNK1Q9BUB5 465 aa15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RSAD1Q9HA92 442 aa15.63■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa15.62■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CCT8L1PA6NM43 557 aa15.62■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP15.62■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 STK4Q13043 487 aa15.62■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DNAJC9Q8WXX5 260 aa15.62■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 EME1Q96AY2 570 aa15.62■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MANSC1Q9H8J5 431 aa15.62■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 COG2Q14746 738 aa15.62■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PTGISQ16647 500 aa15.62■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LVRNQ6Q4G3 990 aa15.62■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OR6J1Q8NGC5 347 aa15.62■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CHMP2BQ9UQN3 213 aa15.62■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 AXIN2Q9Y2T1 843 aa15.62■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ACOT2P49753 483 aa15.62■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP15.62■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 EMC2Q15006 297 aa15.62■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PLD3Q8IV08 490 aa15.62■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OSBPL8Q9BZF1 889 aa15.62■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KCNH4Q9UQ05 1017 aa15.62■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SYTL3Q4VX76 610 aa15.62■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF507Q8TCN5 953 aa15.62■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CALML6Q8TD86 181 aa15.62■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa15.62■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RNF181Q9P0P0 153 aa15.62■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MADDQ8WXG6 1647 aa15.62■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NUP93Q8N1F7 819 aa15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 AGAP3Q96P47 875 aa15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MAP3K14Q99558 947 aa15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FAM107AO95990 144 aa15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HIST1H2ADP20671 130 aa15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ACADSBP45954 432 aa15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PPIL6Q8IXY8 311 aa15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C3orf20Q8ND61 904 aa15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CYGBQ8WWM9 190 aa15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HIST1H2AJQ99878 128 aa15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 H2AFJQ9BTM1 129 aa15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 POLBP06746 335 aa15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 COILP38432 576 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RGS7P49802 495 aa15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.8 ms