RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428075.5

TRIOBP-209, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene TRIOBP, Length 931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-209ENST00000428075 ABCD1P33897 745 aa30.31■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 CCR2P41597 374 aa30.31■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 NASPP49321 788 aaPredicted RBP30.31■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 LILRA4P59901 499 aa30.31■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP30.31■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 ADALQ6DHV7 355 aa30.31■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 MTSS1LQ765P7 747 aa30.31■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 SV2BQ7L1I2 683 aa30.31■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 CD302Q8IX05 232 aa30.31■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 CCDC105Q8IYK2 499 aa30.31■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 MCRS1Q96EZ8 462 aa30.31■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 RTP3Q9BQQ7 232 aa30.31■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa30.31■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP30.31■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 ARHGEF3Q9NR81 526 aa30.31■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 CEP72Q9P209 647 aa30.31■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP30.31■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 COL4A3Q01955 1670 aa30.3■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 ANO9A1A5B4 782 aa30.3■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 C9orf57Q5W0N0 161 aa30.3■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 CORO1BQ9BR76 489 aa30.3■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa30.3■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 CRISPLD1Q9H336 500 aa30.3■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 TBC1D7Q9P0N9 293 aa30.3■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 MYO15AQ9UKN7 3530 aa30.29■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 PIRO00625 290 aa30.29■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 XPOTO43592 962 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 CASP5P51878 434 aa30.29■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 SLFN12LQ6IEE8 588 aa30.29■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 HS6ST3Q8IZP7 471 aa30.29■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 DTWD2Q8NBA8 298 aa30.29■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa30.29■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 HVCN1Q96D96 273 aa30.29■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa30.29■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 SEL1LQ9UBV2 794 aa30.29■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 MAFFQ9ULX9 164 aa30.29■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 DERAQ9Y315 318 aa30.29■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 FRMD3A2A2Y4 597 aa30.28■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 CPB1P15086 417 aa30.28■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 TXLNAP40222 546 aa30.28■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 TMEM132DQ14C87 1099 aa30.28■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa30.28■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 DSTYKQ6XUX3 929 aa30.28■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 LINC00301Q8NCQ3 95 aa30.28■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 SENP8Q96LD8 212 aa30.28■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 ASB7Q9H672 318 aa30.28■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 GDE1Q9NZC3 331 aa30.28■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 SCN1AP35498 2009 aa30.27■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 MOSPD3O75425 235 aa30.27■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 GAP43P17677 238 aa30.27■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 TYMPP19971 482 aa30.27■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 WNT7BP56706 349 aa30.27■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 TWF1Q12792 350 aa30.27■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa30.27■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 SNX21Q969T3 373 aa30.27■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa30.27■■■□□ 2.44
TRIOBP-209ENST00000428075 PROB1E7EW31 1015 aa30.26■■■□□ 2.43
TRIOBP-209ENST00000428075 STK25O00506 426 aa30.26■■■□□ 2.43
TRIOBP-209ENST00000428075 FCARP24071 287 aa30.26■■■□□ 2.43
TRIOBP-209ENST00000428075 STAT6P42226 847 aa30.26■■■□□ 2.43
TRIOBP-209ENST00000428075 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
TRIOBP-209ENST00000428075 EFCAB13Q8IY85 973 aa30.26■■■□□ 2.43
TRIOBP-209ENST00000428075 PGLYRP2Q96PD5 576 aa30.26■■■□□ 2.43
TRIOBP-209ENST00000428075 TMEM209Q96SK2 561 aa30.26■■■□□ 2.43
TRIOBP-209ENST00000428075 OLFML3Q9NRN5 406 aa30.26■■■□□ 2.43
TRIOBP-209ENST00000428075 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
TRIOBP-209ENST00000428075 C2CD2Q9Y426 696 aa30.26■■■□□ 2.43
TRIOBP-209ENST00000428075 OR6C75A6NL08 312 aa30.25■■■□□ 2.43
TRIOBP-209ENST00000428075 NBL1P41271 181 aa30.25■■■□□ 2.43
TRIOBP-209ENST00000428075 EPHA5P54756 1037 aa30.25■■■□□ 2.43
TRIOBP-209ENST00000428075 STARD6P59095 220 aa30.25■■■□□ 2.43
TRIOBP-209ENST00000428075 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
TRIOBP-209ENST00000428075 GPR17Q13304 367 aa30.25■■■□□ 2.43
TRIOBP-209ENST00000428075 TANGO2Q6ICL3 276 aa30.25■■■□□ 2.43
TRIOBP-209ENST00000428075 OVOS1Q6IE37 1185 aa30.25■■■□□ 2.43
TRIOBP-209ENST00000428075 USP37Q86T82 979 aa30.25■■■□□ 2.43
TRIOBP-209ENST00000428075 POMGNT1Q8WZA1 660 aa30.25■■■□□ 2.43
TRIOBP-209ENST00000428075 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
TRIOBP-209ENST00000428075 FOXQ1Q9C009 403 aa30.25■■■□□ 2.43
TRIOBP-209ENST00000428075 YIPF1Q9Y548 306 aa30.25■■■□□ 2.43
TRIOBP-209ENST00000428075 TSC2P49815 1807 aa30.24■■■□□ 2.43
TRIOBP-209ENST00000428075 ECI2O75521 394 aa30.24■■■□□ 2.43
TRIOBP-209ENST00000428075 MICAL2O94851 1124 aa30.24■■■□□ 2.43
TRIOBP-209ENST00000428075 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
TRIOBP-209ENST00000428075 PDILTQ8N807 584 aa30.24■■■□□ 2.43
TRIOBP-209ENST00000428075 ZSWIM3Q96MP5 696 aa30.24■■■□□ 2.43
TRIOBP-209ENST00000428075 LRRC3Q9BY71 257 aa30.24■■■□□ 2.43
TRIOBP-209ENST00000428075 DNAJC25Q9H1X3 360 aa30.24■■■□□ 2.43
TRIOBP-209ENST00000428075 DCNP07585 359 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
TRIOBP-209ENST00000428075 IDEP14735 1019 aa30.23■■■□□ 2.43
TRIOBP-209ENST00000428075 GLULP15104 373 aa30.23■■■□□ 2.43
TRIOBP-209ENST00000428075 STK38Q15208 465 aa30.23■■■□□ 2.43
TRIOBP-209ENST00000428075 ANGPT1Q15389 498 aa30.23■■■□□ 2.43
TRIOBP-209ENST00000428075 E2F4Q16254 413 aa30.23■■■□□ 2.43
TRIOBP-209ENST00000428075 FAM78AQ5JUQ0 283 aa30.23■■■□□ 2.43
TRIOBP-209ENST00000428075 TTC9BQ8N6N2 239 aa30.23■■■□□ 2.43
TRIOBP-209ENST00000428075 OR10T2Q8NGX3 314 aa30.23■■■□□ 2.43
TRIOBP-209ENST00000428075 BORCS6Q96GS4 357 aa30.23■■■□□ 2.43
TRIOBP-209ENST00000428075 ACCSQ96QU6 501 aa30.23■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms