RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424766.5

PMS1-211, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 3

Gene PMS1, Length 831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-211ENST00000424766 ANO6Q4KMQ2 910 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 TCERG1LQ5VWI1 586 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 KIAA1841Q6NSI8 718 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 DSTYKQ6XUX3 929 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 FAM114A1Q8IWE2 563 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 SLC35C1Q96A29 364 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 TMEM8AQ9HCN3 771 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 PCDHB8Q9UN66 801 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 KPNA7A9QM74 516 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 I3L4J1 428 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 SPTLC1O15269 473 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 LILRB3O75022 631 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 ATICP31939 592 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 GCLMP48507 274 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 SCARA3Q6AZY7 606 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 PDXDC1Q6P996 788 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 CEP57Q86XR8 500 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 TRIM59Q8IWR1 403 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 APPL2Q8NEU8 664 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 HPDLQ96IR7 371 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 SENP8Q96LD8 212 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 BPIFA3Q9BQP9 254 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 TRANK1O15050 2925 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 C2orf71A6NGG8 1288 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 VNN1O95497 513 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 STAU1O95793 577 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 MYL5Q02045 173 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 PTPN14Q15678 1187 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 PLPP4Q5VZY2 271 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 KRT39Q6A163 491 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 PIK3R5Q8WYR1 880 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 PPP2R3CQ969Q6 453 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 GDAP2Q9NXN4 497 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 PMM2O15305 246 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 FOSL2P15408 326 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 TYMPP19971 482 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 TKTP29401 623 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 MYL6P60660 151 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 NCOA4Q13772 614 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 RTP2Q5QGT7 225 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 B3GALT6Q96L58 329 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 VRTNQ9H8Y1 702 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 RXFP1Q9HBX9 757 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 FNIP2Q9P278 1114 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 DSEQ9UL01 958 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 CYB561D2O14569 222 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 CAVIN2O95810 425 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 HLA-DRAP01903 254 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 CYP11A1P05108 521 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 ODC1P11926 461 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 MXI1P50539 228 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 CREMQ03060 361 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 ANKS3Q6ZW76 656 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 DPH6Q7L8W6 267 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 CREBRFQ8IUR6 639 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 AUTS2Q8WXX7 1259 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 TAF4BQ92750 862 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 XYLT2Q9H1B5 865 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 MMRN2Q9H8L6 949 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 COQ4Q9Y3A0 265 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa22.16■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 SMTNL1A8MU46 457 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 HIDE1A8MVS5 230 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 H7C4K7 107 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 C2CD2LO14523 706 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 HUS1O60921 280 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 CSPG5O95196 566 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 PIK3CAP42336 1068 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 FMO5P49326 533 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 ZNF165P49910 485 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 KCNH2Q12809 1159 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 FBXL13Q8NEE6 735 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 TLE6Q9H808 572 aa22.15■■□□□ 1.14
PMS1-211ENST00000424766 P4HA2O15460 535 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 OAZ2O95190 189 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 FAM163BP0C2L3 166 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 CA8P35219 290 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 NCAPHQ15003 741 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 PSMD5Q16401 504 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 WDR72Q3MJ13 1102 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-211ENST00000424766 CBWD6Q4V339 395 aa22.14■■□□□ 1.13
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