RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 HDXQ7Z353 690 aa4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM192Q8IY95 271 aa4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 NLRP7Q8WX94 980 aa4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 CPA5Q8WXQ8 436 aa4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF653Q96CK0 615 aa4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 HES6Q96HZ4 224 aa4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 CPB2Q96IY4 423 aa4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 BTBD6Q96KE9 485 aa4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM81BQ96LP2 452 aa4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 AP1M1Q9BXS5 423 aa4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 IFT122Q9HBG6 1241 aa4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 ST7Q9NRC1 585 aa4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC5A4Q9NY91 659 aa4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC15A5A6NIM6 579 aa4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 GPR25O00155 361 aa4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 ABLIM1O14639 778 aa4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 ADCY6O43306 1168 aa4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 KRT19P08727 400 aa4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 CD58P19256 250 aa4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 CYP2B6P20813 491 aa4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 PTPN5P54829 565 aa4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 BPIFB4P59827 614 aa4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 MYL6P60660 151 aa4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 CASP8Q14790 479 aa4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 GRIK4Q16099 956 aa4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 DGKDQ16760 1214 aa4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF394Q53GI3 561 aa4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 NAA35Q5VZE5 725 aa4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 IQSEC1Q6DN90 963 aa4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 ACAD10Q6JQN1 1059 aa4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 MTHFD1LQ6UB35 978 aa4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 WDR49Q8IV35 697 aa4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 PASD1Q8IV76 773 aa4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 CYFIP2Q96F07 1278 aa4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 NUP85Q9BW27 656 aa4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 CDT1Q9H211 546 aa4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 PTPRHQ9HD43 1115 aa4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 SETD4Q9NVD3 440 aa4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM53CQ9NYF3 392 aa4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 KRIT1O00522 736 aa4.25□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 CES2O00748 559 aa4.25□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 FGGP02679 453 aa4.25□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 MMP3P08254 477 aa4.25□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 CFHP08603 1231 aa4.25□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 HOXC6P09630 235 aa4.25□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 WEE2P0C1S8 567 aa4.25□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 CXCL8P10145 99 aa4.25□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 ACO1P21399 889 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 FGFR4P22455 802 aa4.25□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 PROZP22891 400 aa4.25□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 GNA15P30679 374 aa4.25□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 CYP2C19P33261 490 aa4.25□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 AP3M2P53677 418 aa4.25□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 TNNC1P63316 161 aa4.25□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM62Q0P6H9 643 aa4.25□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 SURF1Q15526 300 aa4.25□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa4.25□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 MAP9Q49MG5 647 aa4.25□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa4.25□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 EFCAB13Q8IY85 973 aa4.25□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM130Q8N3G9 435 aa4.25□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 IFT81Q8WYA0 676 aa4.25□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa4.25□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP4.25□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 EPB41L5Q9HCM4 733 aa4.25□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 STIM2Q9P246 746 aa4.25□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 GTF3C4Q9UKN8 822 aa4.25□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 TNFSF13BQ9Y275 285 aa4.25□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 EVPLQ92817 2033 aa4.25□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 ESYT3A0FGR9 886 aa4.25□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 MAP2K7O14733 419 aa4.25□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 THAP12O43422 761 aa4.25□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 SPOPO43791 374 aa4.25□□□□□ -1.73
LRRTM4-201ENST00000409088 ZEB2O60315 1214 aa4.25□□□□□ -1.73
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